[发明专利]串联质谱数据母离子检测模型训练方法及母离子检测方法有效

专利信息
申请号: 201410406562.6 申请日: 2014-08-18
公开(公告)号: CN104215729A 公开(公告)日: 2014-12-17
发明(设计)人: 邬龙;曾文锋;袁作飞;刘超;孟佳明;贺思敏 申请(专利权)人: 中国科学院计算技术研究所
主分类号: G01N30/88 分类号: G01N30/88;G01N30/86;G06F19/00
代理公司: 北京泛华伟业知识产权代理有限公司 11280 代理人: 王勇;李科
地址: 100190 北*** 国省代码: 北京;11
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摘要: 发明提供一种串联质谱母离子检测模型训练方法,包括下列步骤:1)获取母离子已知的谱图数据集,对于其中每张二级谱图,确定该二级谱图的候选母离子;2)提取每个二级谱图-候选母离子组合的特征向量,并根据二级谱图和候选母离子配对正确与否进行相应的赋值;其中,特征向量的元素包括:同位素峰簇相似度、碎裂窗口内的谱峰强度比、色谱相似度和虚拟色谱相似度;3)将所有二级谱图-候选母离子组合的特征向量作为输入,将二级谱图和候选母离子配对正确与否的赋值作为输出,训练MARS模型,得到串联质谱母离子检测模型。本发明还提供了相应的母离子检测方法。本发明能够提高母离子召回率并提高母离子的检测速度。
搜索关键词: 串联 数据 离子 检测 模型 训练 方法
【主权项】:
一种串联质谱母离子检测模型训练方法,包括下列步骤:1)获取母离子已知的谱图数据集,对于其中每张二级谱图,确定该二级谱图的候选母离子;2)提取每个二级谱图‑候选母离子组合的特征向量,并根据二级谱图和候选母离子配对正确与否进行相应的赋值;其中,特征向量的元素包括:同位素峰簇相似度、碎裂窗口内的谱峰强度比、色谱相似度和虚拟色谱相似度;3)将所有二级谱图‑候选母离子组合的特征向量作为输入,将二级谱图和候选母离子配对正确与否的赋值作为输出,训练MARS模型,得到串联质谱母离子检测模型。
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