[发明专利]一种大批量开发苎麻基因组SSR标记的方法及其开发的引物有效

专利信息
申请号: 201410449957.4 申请日: 2014-09-05
公开(公告)号: CN104212897A 公开(公告)日: 2014-12-17
发明(设计)人: 栾明宝;刘晨晨;陈建华;王晓飞;许英;孙志民 申请(专利权)人: 中国农业科学院麻类研究所
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12N15/11
代理公司: 长沙市融智专利事务所 43114 代理人: 袁靖
地址: 410205 湖*** 国省代码: 湖南;43
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摘要: 发明提供了一种大批量开发苎麻基因组SSR的方法及其开发的引物;具体包括如下步骤:(1)提取苎麻的DNA;(2)利用RsaI酶对苎麻基因组进行酶切,获得214-314bp的小片段;(3)对酶切获取的小片段进行测序,获得SLAF标签;(4)对标签,利用SSR hunter搜索SSR序列;(5)对搜索到的SSR序列进行引物设计,经引物多态性检测,得到多态性引物,即为基因组SSR标记。相对于传统的磁珠富集法,方法易行,操作简便,效率高,成本低。大批量苎麻基因组SSR标记的获得,为苎麻分子生物学和遗传学奠定了坚实基础。
搜索关键词: 一种 大批量 开发 苎麻 基因组 ssr 标记 方法 及其 引物
【主权项】:
一种大批量开发苎麻基因组SSR标记的方法,其特征在于,具体包括如下步骤: (1)提取苎麻的DNA; (2)将苎麻基因组DNA酶切为小片段; (3)对酶切后获取的小片段进行测序,获得SLAF标签; (4)对步骤(3)获得的标签,利用SSR hunter搜索SSR序列; (5)对搜索到的SSR序列进行引物设计,经引物多态性检测,得到多态性引物,即为基因组SSR标记。 
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