[发明专利]流式细胞仪数据快速分析方法有效
申请号: | 201410459761.3 | 申请日: | 2014-09-10 |
公开(公告)号: | CN104200114B | 公开(公告)日: | 2017-08-04 |
发明(设计)人: | 王先文;程智;陈锋;杜耀华;暴洪涛;李辰宇;吴太虎 | 申请(专利权)人: | 中国人民解放军军事医学科学院卫生装备研究所 |
主分类号: | G06F19/00 | 分类号: | G06F19/00;G01N15/10 |
代理公司: | 天津市三利专利商标代理有限公司12107 | 代理人: | 仝林叶 |
地址: | 300161 *** | 国省代码: | 天津;12 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | 本发明公开了一种流式细胞仪数据快速分析方法。本发明包括以下步骤(1)采用核密度估计方法对流式细胞仪数据中的类群数目进行估计,得到数据中包含的类群数目范围;(2)获得类群数目后,采用优化初始聚类中心的K‑means方法对数据进行自动聚类;(3)对聚类后的结果,采用两段线性回归拟合方法合并筛选最优结果。该分析方法分析流式细胞仪数据的结果精确度高,分析时间远远低于人工分析数据时间及目前其他分析方法。 | ||
搜索关键词: | 细胞 数据 快速 分析 方法 | ||
【主权项】:
一种流式细胞仪数据快速分析方法,其特征在于,按照以下步骤进行:(1)采用核密度估计方法对流式细胞仪数据中的类群数目进行估计,得到数据中包含的类群数目范围;(2)获得类群数目后,采用优化初始聚类中心的K‑means方法对数据进行自动聚类;(3)对聚类后的结果,采用两段线性回归拟合方法合并筛选最优结果;所述步骤(1)采用了核密度估计方法对流式细胞仪数据中的类群数目进行估计的识别过程如下:设为流式细胞仪数据X的核密度估计,其可表示为:其中Xi代表数据中的事件,则对两边求导可得到其中:K为核函数,且H为d×d维正定对称带宽矩阵;▽(2)K{x}表示K{x}的二阶导数;利用线性分割网格方法可得到每一维度的类群数目kj,其中j=1,…,d,则类群数目范围为所述步骤(2)中K‑means方法采用了以下过程进行初始聚类中心确定:(1)在样本中随机选择xi作为第一个聚类中心c1;(2)计算所有样本x到前k‑1个聚类中心的最小距离,其中k=2,…K,(3)以为概率选择xi为第k个聚类中心ck。
下载完整专利技术内容需要扣除积分,VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于中国人民解放军军事医学科学院卫生装备研究所,未经中国人民解放军军事医学科学院卫生装备研究所许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/patent/201410459761.3/,转载请声明来源钻瓜专利网。
- 同类专利
- 专利分类
G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
- 数据显示系统、数据中继设备、数据中继方法、数据系统、接收设备和数据读取方法
- 数据记录方法、数据记录装置、数据记录媒体、数据重播方法和数据重播装置
- 数据发送方法、数据发送系统、数据发送装置以及数据结构
- 数据显示系统、数据中继设备、数据中继方法及数据系统
- 数据嵌入装置、数据嵌入方法、数据提取装置及数据提取方法
- 数据管理装置、数据编辑装置、数据阅览装置、数据管理方法、数据编辑方法以及数据阅览方法
- 数据发送和数据接收设备、数据发送和数据接收方法
- 数据发送装置、数据接收装置、数据收发系统、数据发送方法、数据接收方法和数据收发方法
- 数据发送方法、数据再现方法、数据发送装置及数据再现装置
- 数据发送方法、数据再现方法、数据发送装置及数据再现装置