[发明专利]5-醛基胞嘧啶特异性化学标记方法及相关应用

摘要

本发明涉及5‑醛基胞嘧啶特异性化学标记方法及在测序、检测、成像及诊疗等方面的相关应用。该方法是利用含有侧链活性基团的活泼亚甲基化合物中的活泼亚甲基与5‑醛基胞嘧啶或其1号位取代的衍生物中的醛基发生缩合反应，同时使其侧链活性基团与胞嘧啶4号位氨基发生分子内反应实现关环。利用本发明的5‑醛基胞嘧啶特异性化学标记方法及相关化合物，可实现检测核酸分子中5‑醛基胞嘧啶的含量，特异性富集含5‑醛基胞嘧啶的核酸样品，分析核酸分子中5‑醛基胞嘧啶的序列分布信息和/或单碱基分辨率序列信息等。本发明为表观遗传学及核酸化学生物学研究领域提供了多个有效的研究方法。

主权项

一种特异性化学标记5‑醛基胞嘧啶或其1号位取代的衍生物的方法，将含有侧链活性基团的活泼亚甲基化合物R1‑CH2‑R2与5‑醛基胞嘧啶或其1号位取代的衍生物进行反应，其中所述含有侧链活性基团的活泼亚甲基化合物与所述5‑醛基胞嘧啶或其1号位取代的衍生物中的胞嘧啶5号位醛基发生脱水缩合反应，同时，所述活泼亚甲基化合物中的侧链活性基团与所述5‑醛基胞嘧啶或其1号位取代的衍生物中的胞嘧啶4号位氨基发生分子内反应实现关环，如下式所示：其中，R代表氢，烃基，带‑OH、‑NH2、‑CHO和/或‑COOH的烃基，或者是核糖基或脱氧核糖基，5’或3’磷酸修饰的核糖基或脱氧核糖基，核糖核酸或脱氧核糖核酸中以糖苷键与5‑醛基胞嘧啶1号位键合的相关小分子化合物或聚合大分子化合物内除5‑醛基胞嘧啶外的其他结构；R1和R2为吸电子基团，相互独立或成环，当R1和R2相互独立时，R1选自氰基、硝基、醛基、羰基化合物和羧酸及其衍生物中的一种，R2选自氰基、醛基、羰基化合物和羧酸及其衍生物中的一种，其中R3代表烃基或带‑OH、‑NH2、‑CHO、‑COOH、叠氮基团和/或生物素的烃基；当R1和R2成环时，是上述R1和R2基团侧链直接键合成环，或通过C、N或O间接键合成环；所述烃基为C1‑C30的直链或带支链的烷基、烯基或炔基。