[发明专利]基于基因与蛋白调控网络的林木精准育种方法和系统有效
申请号: | 201410532915.7 | 申请日: | 2014-10-10 |
公开(公告)号: | CN104361263B | 公开(公告)日: | 2018-03-27 |
发明(设计)人: | 邬荣领;姜立波;张健;王晶;张苗苗 | 申请(专利权)人: | 北京林业大学 |
主分类号: | G06F19/18 | 分类号: | G06F19/18 |
代理公司: | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙)11201 | 代理人: | 张大威 |
地址: | 100083 *** | 国省代码: | 北京;11 |
权利要求书: | 查看更多 | 说明书: | 查看更多 |
摘要: | 本发明公开了一种基于基因与蛋白调控网络的林木精准育种方法和系统,其中,所述方法包括根据表型的形成过程定位表达数量性状位点eQTL、蛋白质数量性状位点pQTL和代谢数量性状位点mQTL,并构建基因与蛋白调控网络系统的系统模型;根据所述eQTL、所述pQTL、所述mQTL和所述系统模型定位影响所述基因与蛋白调控网络系统的网络数量性状位点nQTL;根据所述eQTL、所述pQTL、所述mQTL和所述nQTL生成林木育种应用程序;根据所述林木育种应用程序进行林木育种。本发明实施的基于基因与蛋白调控网络的林木精准育种方法,大大的缩短了育种周期。此外,根据育种目标有意识地整合目标基因,育种方向更加精准,实现了定向高效育种。 | ||
搜索关键词: | 基于 基因 蛋白 调控 网络 林木 育种 方法 系统 | ||
【主权项】:
一种基于基因与蛋白调控网络的林木育种方法,其特征在于,包括:根据表型的形成过程定位表达数量性状位点eQTL、蛋白质数量性状位点pQTL和代谢数量性状位点mQTL,并构建基因与蛋白调控网络系统的系统模型;根据所述eQTL、所述pQTL、所述mQTL和所述系统模型定位影响所述基因与蛋白调控网络系统的网络数量性状位点nQTL;根据所述eQTL、所述pQTL、所述mQTL和所述nQTL生成林木育种应用程序;通过模拟试验对所述林木育种应用程序进行统计测验,并在所述林木育种应用程序通过所述统计测验时,根据所述林木育种应用程序进行林木育种,其中,所述通过模拟试验对所述林木育种应用程序进行检测,包括:生成多组林木育种模拟数据,其中,所述多组林木育种模拟数据的数据分别具有不同的预设参数,所述预设参数包括遗传力、样本大小、表型测定频度中的一种或多种;分别针对所述多组林木育种模拟数据执行所述林木育种应用程序,并根据执行结果和所述预设参数获取所述林木育种应用程序的参数估计精度、显著基因发现功效和假阳性发现率;当所述林木育种应用程序的参数估计精度、显著基因发现功效和假阳性发现率满足预设条件时,所述林木育种应用程序通过所述统计测验。
下载完整专利技术内容需要扣除积分,VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息,商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于北京林业大学,未经北京林业大学许可,擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作,请联系【客服】
本文链接:http://www.vipzhuanli.com/patent/201410532915.7/,转载请声明来源钻瓜专利网。
- 同类专利
- 专利分类
G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用