[发明专利]基于基因与蛋白调控网络的林木精准育种方法和系统有效

专利信息
申请号: 201410532915.7 申请日: 2014-10-10
公开(公告)号: CN104361263B 公开(公告)日: 2018-03-27
发明(设计)人: 邬荣领;姜立波;张健;王晶;张苗苗 申请(专利权)人: 北京林业大学
主分类号: G06F19/18 分类号: G06F19/18
代理公司: 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙)11201 代理人: 张大威
地址: 100083 *** 国省代码: 北京;11
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摘要: 发明公开了一种基于基因与蛋白调控网络的林木精准育种方法和系统,其中,所述方法包括根据表型的形成过程定位表达数量性状位点eQTL、蛋白质数量性状位点pQTL和代谢数量性状位点mQTL,并构建基因与蛋白调控网络系统的系统模型;根据所述eQTL、所述pQTL、所述mQTL和所述系统模型定位影响所述基因与蛋白调控网络系统的网络数量性状位点nQTL;根据所述eQTL、所述pQTL、所述mQTL和所述nQTL生成林木育种应用程序;根据所述林木育种应用程序进行林木育种。本发明实施的基于基因与蛋白调控网络的林木精准育种方法,大大的缩短了育种周期。此外,根据育种目标有意识地整合目标基因,育种方向更加精准,实现了定向高效育种。
搜索关键词: 基于 基因 蛋白 调控 网络 林木 育种 方法 系统
【主权项】:
一种基于基因与蛋白调控网络的林木育种方法,其特征在于,包括:根据表型的形成过程定位表达数量性状位点eQTL、蛋白质数量性状位点pQTL和代谢数量性状位点mQTL,并构建基因与蛋白调控网络系统的系统模型;根据所述eQTL、所述pQTL、所述mQTL和所述系统模型定位影响所述基因与蛋白调控网络系统的网络数量性状位点nQTL;根据所述eQTL、所述pQTL、所述mQTL和所述nQTL生成林木育种应用程序;通过模拟试验对所述林木育种应用程序进行统计测验,并在所述林木育种应用程序通过所述统计测验时,根据所述林木育种应用程序进行林木育种,其中,所述通过模拟试验对所述林木育种应用程序进行检测,包括:生成多组林木育种模拟数据,其中,所述多组林木育种模拟数据的数据分别具有不同的预设参数,所述预设参数包括遗传力、样本大小、表型测定频度中的一种或多种;分别针对所述多组林木育种模拟数据执行所述林木育种应用程序,并根据执行结果和所述预设参数获取所述林木育种应用程序的参数估计精度、显著基因发现功效和假阳性发现率;当所述林木育种应用程序的参数估计精度、显著基因发现功效和假阳性发现率满足预设条件时,所述林木育种应用程序通过所述统计测验。
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