[发明专利]癌症体细胞突变基因测序数据分析工作流整合算法在审
| 申请号： | 201410571652.0 | 申请日： | 2014-10-24 |
| 公开（公告）号： | CN104408284A | 公开（公告）日： | 2015-03-11 |
| 发明（设计）人： | 吴翀;王瑜;闫威 | 申请（专利权）人： | 北京微旋基因技术有限公司 |
| 主分类号： | G06F19/00 | 分类号： | G06F19/00 |
| 代理公司： | 暂无信息 | 代理人： | 暂无信息 |
| 地址： | 100083*** | 国省代码： | 北京;11 |
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| 摘要： | 本发明涉及一种，癌症体细胞突变基因测序数据分析工作流整合算法，包括如下步骤：(1)测序数据比对使用cushaw算法；(2)SNP鉴定使用samtools算法；(3)癌症体细胞突变鉴定使用VarScan算法。 | ||
| 搜索关键词： | 癌症 体细胞 突变 基因 序数 分析 工作流 整合 算法 | ||
【主权项】：
癌症体细胞突变基因测序分析数据工作流整合算法，其特征在于，包括如下步骤：(1)将测序数据比对到参考基因组序列，使用bwa算法，使用科学运算流处理器加速后，数据比对速度提高至其他软件的10‑100倍；(2)SNP鉴定，使用samtools算法，兼容多种数据格式，准确度高，定位快速；(3)癌症体细胞突变鉴定，使用VarScan算法，兼容数据种类多，准确度高，输入输出符合公开标准。
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