[发明专利]鉴别DNA基因序列中编码区域与非编码区域的系统

摘要

本发明提供一种鉴别DNA基因序列中编码区域与非编码区域的系统，计算一个DNA序列的DRT谱，通过其在k＝3处与其他地方的谱值的比较来判别这个序列究竟是外显子还是内含子：DRT谱在k＝3处的值高于其它地方的值，则为外显子；否则，为内含子。通过数值化的DNA序列的离散Ramanujan谱及其信噪比，用来区分蛋白质的编码区域与非编码区域，测试结果显示了本发明方法的可靠性。对比于傅里叶变换，离散Ramanujan谱的计算量更小，精度更高。

主权项

一种鉴别DNA基因序列中编码区域与非编码区域的系统，其特征在于，包括数据处理模块、显示模块、输入输出模块和存储模块；存储模块：存放DNA序列的片段的数据文件，并存放数据处理模块得到的结果文件；显示模块：对数据处理模块的过程及结果进行显示；输入输出模块：用于对数据处理模块进行数据输入或输出；数据处理模块：读取存储模块内的DNA序列的片段的数据文件，得到一个完整DNA序列，计算DNA序列经过离散Ramanujan变换后所得的DRT谱在3处的信噪比，进行编码区域与非编码区域的鉴别，具体为：计算一个DNA序列的DRT谱，DRT的谱为P(k)＝|X(k)²,k＝1,2,......,N，X(k)为DRT的Ramanujan系数；通过其在k＝3处与其他地方的谱值的比较来判别这个序列究竟是外显子还是内含子：DRT谱在k＝3处的值高于其它地方的值，则为外显子；否则，为内含子。