[发明专利]均值二分法分块排序的正方化树图布局算法有效
申请号: | 201410670722.8 | 申请日: | 2014-11-20 |
公开(公告)号: | CN104376218A | 公开(公告)日: | 2015-02-25 |
发明(设计)人: | 杜景林;朱兴宇;沈晓燕;周光胜;侯大俊 | 申请(专利权)人: | 南京信息工程大学 |
主分类号: | G06F19/00 | 分类号: | G06F19/00 |
代理公司: | 南京众联专利代理有限公司 32206 | 代理人: | 顾进 |
地址: | 210044 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | 本发明涉及一种均值二分法分块排序的正方化树图布局算法,包括:步骤一、定义原始数据集;步骤二、对数据集A中元素进行首尾相减推移计算;步骤三、结合长边摆放策略对数据元素进行正方化计算。本发明减少了矩形平均长宽比的损失,保留了可视化结果的部分顺序信息,同时在数据集更新时可以提高可视化布局的稳定性。 | ||
搜索关键词: | 均值 二分法 分块 排序 正方 化树图 布局 算法 | ||
【主权项】:
均值二分法分块排序的正方化树图布局算法,其特征在于,包括以下步骤,步骤一、原始数据集为A={x1,x2,...,xj,...,xm},j=1,2,...,m,其中m为元素个数,用户自定义矩形混乱阈值为μ,初始待绘制矩形为R,m1,m2分别为A1,A2数据子集中的元素个数,q1,q2分别为A1,A2数据子集中元素的起始序号,则有q1=1,q2=q1+m1;
分别为A1,A2数据子集中元素权值之和,
数据集A的分割点t为每次分割时第二个数据子集中第一个元素的序号,用户自定义长宽比阈值L;步骤二、对数据集A中元素进行首尾相减推移计算,(1)将A中的首尾元素依次相减,并计算相减所得到的值之和S,
(2)若S>0,则转至(3),否则若m为奇数,S加上序号为(m+1)/2的元素权值之后,开始依次向后加元素2倍权值;若m为偶数,S从序号为(m+1)/2的元素开始依次向后加元素2倍权值,记录每次操作对应的元素序号j、Snow和前一步操作的Sold,直至Snow>0,转至(4);(3)若m为奇数,S减去序号为(m+1)/2的元素权值之后,开始依次向前减元素2倍权值;若m为偶数,S从序号为
的元素开始依次向前减元素2倍权值,分别记录每次操作对应的元素序号j和Snow和前一步操作的Sold,直至Snow<0,转至步骤(5);(4)比较|Snow|和|Sold|,若|Snow|>|Sold|,则分割点t=j,否则t=j+1;(5)比较|Snow|和|Sold|,若|Snow|>|Sold|,则分割点t=j+1,否则t=j;步骤三、结合长边摆放策略对数据元素进行正方化计算,(a)比较m和μ,若m≤μ,则跳转至(e);(b)按照步骤二(4)和(5)确定数据集的分割点t,并分割数据子集为A1,A2;(c)计算数据子集A1,A2的权值之和
根据
的比例关系分割待绘制矩形R的长边,从而得到数据子集A1,A2对应的待绘制子矩形R1,R2;(d)将数据子集A1,A2分别设置为A,将待绘制子矩形R1,R2设置为待绘制矩形R,重复(a)到(c),直到分割得到的所有数据子集中的元素个数均小于μ;(e)依次设置每个数据子集为当前的数据集,设置每个待绘制子矩形为当前的待绘制矩形,每个数据集按照数据权值从大到小的顺序进行排序;(f)若当前待绘制子矩形的长宽比大于长宽比阈值L,则转到(i);(g)从当前数据子集按照数据权值从大到小的顺序依次取出当前数据集中的元素,放在待绘制子矩形的长边,记录平均长宽比;(h)重复步骤(g),直到当前加入数据元素增加了平均长宽比,计算当前阶段加入的数据元素的平均长宽比kl;(i)按照数据权值从大到小的顺序依次取出当前数据集中的元素,放在待绘制子矩形的短边,记录平均长宽比;(j)重复步骤(i),直到当前加入的数据元素增加了平均长宽比,计算当前阶段加入的数据元素的平均长宽比ks;(k)比较kl和ks,选择平均长宽比小的摆放策略;(l)返回步骤(e),直至所有数据子集中的元素均被插入。
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G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
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