[发明专利]一种预测有机化学品的皮肤渗透系数的方法有效

专利信息
申请号: 201410676421.6 申请日: 2014-11-21
公开(公告)号: CN104376221B 公开(公告)日: 2018-06-15
发明(设计)人: 范德玲;刘济宁;王蕾;汪贞;周林军;郭敏;古文;石利利 申请(专利权)人: 环境保护部南京环境科学研究所
主分类号: G06F19/00 分类号: G06F19/00
代理公司: 北京亿腾知识产权代理事务所 11309 代理人: 陈惠莲
地址: 210042 *** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明涉及健康风险评估测试策略领域,具体来说,涉及一种预测有机化学品的皮肤渗透系数方法。在获得化合物分子结构的基础上,通过计算表征结构特征的描述符,应用定量结构活性关系QSAR构建预测模型,与传统试验方法测定皮肤渗透参数相比,符合动物福利保护,减少了测试时间和成本,能够快速有效的预测皮肤渗透系数。本发明严格按照经济合作与发展组织(OECD)提出QSAR模型构建和使用准则规定的5个标准,通过计算化合物物理化学、电性能、拓扑和量子化学参数作为预测描述符,利用K‑S分组将原始数据进行分类,筛选出7种最优描述符,运用清晰、简单、快速、透明的GA‑MLR算法,模型应用域明确,具有良好的拟合效果、稳健性和预测能力。皮肤渗透系数预测模型能够准确、高效地完成化合物皮肤渗透系数的预测,为有机化合物健康危害评价提供有效方法。 1
搜索关键词: 皮肤渗透 描述符 预测 有机化学品 构建 定量结构活性关系 物理化学 健康风险评估 量子化学参数 计算化合物 有机化合物 表征结构 测试策略 传统试验 动物福利 分子结构 模型应用 系数预测 预测模型 预测能力 原始数据 电性能 透明的 稳健性 拟合 拓扑 算法 测试 分组 筛选 分类 清晰 应用 健康
【主权项】:
1.一种预测有机化学品的皮肤渗透系数的方法,其特征在于:

步骤一、从收集132个化合物的皮肤渗透系数数据;

步骤二、按照K‑S分组方法将步骤一的样本数据集进行分组,其中训练集共选取92个样本化合物,验证集共选取40个样本化合物;所述训练集用于构建预测模型,验证集数据用于外部验证,内部验证采用留一法交互验证;分组后的数据如下:

皮肤渗透性模型化合物信息

步骤三、建立模型:采用遗传算法进行变量选择,所使用的相关参数为:种群数100,变异概率0.5,模型中允许的最大特征个数10,其他参数均为默认值;当增加变量数目对模型结果影响不大时,筛选出影响皮肤渗透性的7个最优描述符数,采用多元线性回归方法建立了线性模型;

筛选出7种分子描述符及模型如下:

GLA‑MLR线性方程:

Log Fl=–0.323–0.510BEHm8–0.316GGI2–0.064RDF030u–2.173Mor17v–0.446G2s+1.587H5m+2.546RTu+

所述BEHm8表示Burden特征值,GGI2表示拓扑电荷指数,RDF030u表示分子体积,Mor17v表示分子的3D结构和大小,G2s属于WHIM描述符,H5m表示分子的大小和原子的性质,RTu+表示化合物结构片段的相关信息;

所述训练集和验证集实验值和预测值的相关系数分别达到0.862和0.614;步骤四、预测未知化合物的皮肤渗透系数,未知化合物经过分子结构的输入和结构优化过程,通过Dragon软件计算7种描述符,分别为上述BEHm8、GGI2、RDF030v、Mor17v、G2s、H5m、RTu+,利用步骤三的预测模型得到未知化合物预测值;

所述方法用于化合物6‑氯‑N2‑乙基‑N4‑异丙基‑1,3,5‑三嗪‑2,4‑二胺、1,1,1‑三氯乙烷、O,O‑二甲基‑O‑(2,4,5‑三氯苯基)硫逐磷酸酯的皮肤渗透系数的预测。

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