[发明专利]通过模块化选择实现的生物信息项目自动分析方法及系统

摘要

公开了一种通过模块化选择实现的生物信息项目自动分析方法，包括步骤创建项目并存于业务管理系统中，每个项目包括多个子项目；由用户根据子项目和任务信息直接选择所述创建项目中需要的分析模块；当子项目的类型为标准化子项目，则子项目对应的样品在经测序仪测序的同时，供用户选择对该样品创建一种或多种的模块化的标准流程分析，且由用户根据当前子项目的样品情况、测序类型、分析目的选择匹配的过滤模块及输入对应的比对参数；经测序仪测序完成后，根据所述过滤模块及比对参数对每一样品数据进行过滤，从而去掉不符合比对参数的样品数据；然后再运用所创建的标准流程分析模块对符合比对参数的每一样品数据进行分析，生成分析结果。

主权项

一种通过模块化选择实现的生物信息项目自动分析方法，其特征在于，包括步骤：步骤一：创建项目并存于业务管理系统中，每个项目包括多个子项目；并由用户根据子项目和任务信息直接选择所述创建项目中需要的分析模块；所述子项目的类型包括只过滤子项目和标准化子项目；步骤二：当所述子项目的类型为标准化子项目时，则该子项目对应的样品在经测序仪测序的同时，供用户选择对该样品创建包括过滤分析、表达谱定量分析、差异比较分析、Cluster聚类分析、靶基因预测分析、KOGO分析和碱基编辑分析中的一种或多种的模块化的标准流程分析，且在创建每个标准流程分析过程中由用户根据当前子项目的样品情况、测序类型、分析目的选择匹配的过滤模块及输入对应的比对参数；经测序仪测序完成后，根据所述过滤模块及比对参数对每一样品数据进行过滤，从而去掉不符合比对参数的样品数据；然后再运用所创建的标准流程分析模块对符合比对参数的每一样品数据进行分析，从而生成分析结果，分析结果包括子项目信息和对应的样品信息；当所述子项目的类型为只过滤子项目，则根据选择的子项目类型和任务信息，依次从下机数据管理系统中获取对应的且经过测序仪测序后的样品数据；且每获取一个样品数据，即根据预设的参数配置运用统一的过滤标准进行过滤与分析，从而过滤不符合参数配置的样品数据；且待获取的所有样品数据过滤与分析完后，生成分析结果，分析结果包括子项目信息和对应的样品信息；步骤三：由用户选择质控模块以及输入对应的质控参数来对所述分析结果进行质控，若质控通过，则直接输出该分析结果；若质控不通过，且所述分析结果和质控标准的差距在阈值范围内，则重新编辑所述样品数据或过滤/质控参数后再次进行步骤二的过滤与分析过程，直至分析结果通过质控；若质控不通过，且所述分析结果和质控标准的差距超过阈值，则编辑所述样品且废弃相关Lane,并在所述业务管理系统中重新下单。