[发明专利]在项目分析流程中自动建立数据库的方法及系统有效
申请号: | 201410742443.8 | 申请日: | 2014-12-08 |
公开(公告)号: | CN104484375B | 公开(公告)日: | 2017-11-10 |
发明(设计)人: | 苏海桥;唐启覃;周良风;窦文祥;蔡雄颖;邹利君;陈勇;刘娜;梁绍光;李国庆 | 申请(专利权)人: | 深圳华大基因科技服务有限公司 |
主分类号: | G06F17/30 | 分类号: | G06F17/30;G06F19/00 |
代理公司: | 广州三环专利商标代理有限公司44202 | 代理人: | 梁顺宜,郝传鑫 |
地址: | 518083 广东省深圳市*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | 公开了一种在项目分析流程中自动建立数据库的方法,包括步骤创建项目并存于业务管理系统中,每个项目包括多个子项目;当子项目的类型为标准化子项目时,则该子项目对应的样品在经测序仪测序的同时,对该样品创建标准流程分析,且在创建每个标准流程分析过程中由用户选择建立的数据库以及根据当前子项目的样品情况、测序类型、分析目的向数据库输入对应的比对参数;经测序仪测序完成后,根据所述数据库中的比对参数对每一样品数据进行过滤,从而去掉不符合比对参数的样品数据;然后再运用所创建的标准流程分析对符合比对参数的每一样品数据进行分析,生成分析结果。 | ||
搜索关键词: | 项目 分析 流程 自动 建立 数据库 方法 系统 | ||
【主权项】:
一种在项目分析流程中自动建立数据库的方法,其特征在于,包括步骤:步骤一:创建项目并存于业务管理系统中,每个项目包括多个子项目;并选择所述创建项目中的子项目和任务信息;所述子项目的类型包括只过滤子项目和标准化子项目;步骤二:当所述子项目的类型为标准化子项目时,则该子项目对应的样品在经测序仪测序的同时,对该样品创建包括过滤分析、表达谱定量分析、差异比较分析、Cluster聚类分析、靶基因预测分析、KOGO分析和碱基编辑分析中的一种或多种的标准流程分析,且在创建每个标准流程分析过程中由用户选择建立的数据库以及根据当前子项目的样品情况、测序类型、分析目的向数据库输入对应的比对参数;经测序仪测序完成后,根据所述数据库中的比对参数对每一样品数据进行过滤,从而去掉不符合比对参数的样品数据;然后再运用所创建的标准流程分析对符合比对参数的每一样品数据进行分析,从而生成分析结果,分析结果包括子项目信息和对应的样品信息;其中,可供用户选择建立的所述数据库为个人数据库,包括Genome数据库和targerGene数据库;步骤三:对所述分析结果进行质控,若质控通过,则直接输出该分析结果;若质控不通过,且所述分析结果和质控标准的差距在阈值范围内,则重新编辑所述样品数据或过滤/质控参数后再次进行步骤二的过滤与分析过程,直至分析 结果通过质控;若质控不通过,且所述分析结果和质控标准的差距超过阈值,则编辑所述样品且废弃相关Lane,并在所述业务管理系统中重新下单。
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