[发明专利]一种生物标志物相关性可视化方法以及装置有效
| 申请号： | 201410853550.8 | 申请日： | 2014-12-30 |
| 公开（公告）号： | CN104573411B | 公开（公告）日： | 2018-04-17 |
| 发明（设计）人： | 周丰丰;孟庆汉 | 申请（专利权）人： | 深圳先进技术研究院 |
| 主分类号： | G06F19/26 | 分类号： | G06F19/26 |
| 代理公司： | 广州三环专利商标代理有限公司44202 | 代理人： | 郝传鑫,熊永强 |
| 地址： | 518055 广东省深圳*** | 国省代码： | 广东;44 |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | 本发明公开了一种生物标志物相关性可视化方法以及装置。所述方法包括根据第i个标志物的多个采样样本计算第i个标志物的费舍尔比率；重复上一个步骤，直到求出每个的标志物的费舍尔比率；根据第a个标志物的多个采样样本和第b个标志物的多个采样样本计算出第a个标志物和第b个标志物之间的距离；重复上一个步骤，直到求出任意两个标志物之间的距离；将所有的两个标志物之间的距离和降维后的维度作为多维标度算法的输入，从而获得每个标志物的坐标值；根据每个标志物的费舍尔比率获得每个标志物在散点图上的大小，并根据每个标志物的坐标值获得每个标志物在散点图上的坐标，进而使得标志物相关性可视化。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 标志 相关性 可视化 方法 以及 装置 | ||
【主权项】：
一种生物标志物相关性可视化方法，其特征在于，包括：根据第i个标志物的多个采样样本计算所述第i个标志物的费舍尔比率，其中，i为正整数，i小于或等于M，M为所述标志物的数量，N为所述采样样本的数量；重复上一个步骤，直到求出每个的标志物的费舍尔比率；根据第a个标志物的多个采样样本和第b个标志物的多个采样样本计算出第a个标志物和第b个标志物之间的距离，其中，a，b均为正整数，a，b均小于或等于M；重复上一个步骤，直到求出任意两个标志物之间的距离；将所有的两个标志物之间的距离和降维后的维度作为多维标度算法的输入，从而获得每个标志物的坐标值；根据每个标志物的费舍尔比率获得每个标志物在散点图上的大小，并根据每个标志物的坐标值获得每个标志物在散点图上的坐标，进而使得所述标志物相关性可视化。
下载完整专利技术内容需要扣除积分，VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息，商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于深圳先进技术研究院，未经深圳先进技术研究院许可，擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作，请联系【客服】
本文链接：http://www.vipzhuanli.com/patent/201410853550.8/，转载请声明来源钻瓜专利网。
- 同类专利
- 专利分类
G06 计算；推算；计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学，即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真，例如：概率模型或动态模型，遗传基因管理网络，蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的，例如：进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的，例如：结构排序，结构或功能关系，蛋白质折叠，结构域拓扑，用结构数据的药靶，涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的，例如：基因型–表型关联，不均衡连接，种群遗传学，结合位置鉴定，变异发生，基因型或染色体组的注释，蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学，即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真，例如：概率模型或动态模型，遗传基因管理网络，蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的，例如：进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的，例如：结构排序，结构或功能关系，蛋白质折叠，结构域拓扑，用结构数据的药靶，涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的，例如：基因型–表型关联，不均衡连接，种群遗传学，结合位置鉴定，变异发生，基因型或染色体组的注释，蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
