[发明专利]确定多胎妊娠的胎儿基因组

摘要

提供了在有多个胎儿的妊娠期内确定母系和父系单倍型的遗传的技术。可在母体为杂合子并且父系遗传性等位基因已知(例如，父体为纯合子)的基因座处确定母系遗传。可使用两种类型的基因座，其中一种类型具有在第一母系单倍型上出现的父系等位基因，而另一种类型具有在第二母系单倍型上出现的父系等位基因。可由父体为杂合子而母体为纯合子的基因座确定父系遗传。可测量每个基因座处不同等位基因的量。量的比较(例如，使用每个等位基因的百分比浓度和阈值)可用于确定单倍型的遗传情况。单倍型可与目标病状相关联。

主权项

1.一种确定在由雄性受精的雌性的两个胎儿中母系单倍型的遗传的非诊断目的的方法，所述方法包括：鉴定第一染色体上第一组的多个第一基因座，其中所述雌性在每个第一基因座处为各个第一等位基因和各个第二等位基因的杂合子，第一母系单倍型具有所述第一等位基因并且第二母系单倍型具有所述第二等位基因；确定所述两个胎儿从所述雄性遗传了所述第一基因座处的所述各个第一等位基因；鉴定所述第一染色体上第二组的多个第二基因座，其中在所述第二组的每个第二基因座处，所述第一母系单倍型具有各个第三等位基因并且所述第二母系单倍型具有各个第四等位基因，并且确定所述两个胎儿从所述雄性遗传了所述第二基因座处的所述各个第四等位基因；测量在来自于所述雌性的生物样品的DNA片段中存在于所述第一基因座的所述各个第一等位基因的第一量和所述各个第二等位基因的第二量，所述生物样品包括所述雌性和所述两个胎儿的游离DNA；测量在所述生物样品的DNA片段中存在于所述第二基因座的所述各个第三等位基因的第三量和所述各个第四等位基因的第四量；并且通过以下确定所述两个胎儿中母系单倍型的遗传：(i)当所述第一量在统计上高于所述第二量并且所述第三量在统计上等于所述第四量时，将两个胎儿鉴定为已经遗传了所述第一母系单倍型，(ii)当所述第一量在统计上等于所述第二量并且所述第四量在统计上高于所述第三量时，将两个胎儿鉴定为已经遗传了所述第二母系单倍型，或(iii)当所述第一量在统计上高于所述第二量时并且当所述第四量在统计上高于所述第三量时，将所述胎儿其中之一鉴定为遗传了所述第一母系单倍型而将另一个胎儿鉴定为遗传了所述第二母系单倍型。