[发明专利]提取胰腺癌诊断生物标志物的方法、用于该方法的计算装置、胰腺癌诊断生物标志物以及包含该生物标志物的胰腺癌诊断装置

摘要

本发明公开了提取胰腺癌诊断用生物标志物的方法、用于所述方法的计算装置、胰腺癌诊断用生物标志物以及包含该生物标志物的胰腺癌诊断用装置。更具体地，本发明公开了利用在胰腺癌患者中特异性表达的基因或者获自血液或组织的与所述基因配对的微RNA来提取胰腺癌诊断用生物标志物的方法、用于所述方法的计算装置、胰腺癌诊断用生物标志物以及包含该生物标志物的胰腺癌诊断用装置。

主权项

1.一种用于提取胰腺癌诊断用生物标志物的装置，所述装置包括：用于计算以数字形式表示微RNA和基因之间的互补结合能力的相互作用评分的第一单元；用于确定n个微RNA-基因对的第二单元，其中每对的相互作用评分在上述相互作用评分中都较高；和用于从所述n个微RNA-基因对中提取出与在胰腺癌患者中特异性表达的基因相同的基因或与所述基因配对的微RNA的第三单元；其中，所述计算包括：获取以统计学方式获自微RNA和基因之间的预测评分的一个或多个数据库；由微RNA和基因之间的所述预测评分计算出归一化评分；基于所述归一化评分，计算出各微RNA相对于每个基因的结合排位以及各基因相对于每个微RNA的结合排位；和基于微RNA的所述结合排位和基因的所述结合排位计算出所述相互作用评分；其中，所述归一化评分中的每一个都基于所述微RNA-基因对在所述数据库中的预测评分的排位来计算，并根据以下等式1来计算：[等式1] Σ i = 1 n ( T i + 1 - R i , j ) T i ]]>等式1中，i代表第i个数据库，n代表数据库的数目，Ti代表第i个数据库中的miRNA-基因对的总数，且Ri,j代表第j对miRNA-基因对在第i个数据库中的预测评分排位；并且其中，所述相互作用评分中的每一个都基于微RNA相对于每个基因的基于所述归一化评分的排位和基因相对于每个微RNA的基于所述归一化评分的排位来计算，并根据以下等式2来计算：[等式2] ( t m i + 1 - r m i t m i ) × ( t g j + 1 - r g j t g j ) ]]>等式2中，tmi代表第i个miRNA与各基因之间配对的数目，即miRNAi-基因的数目；tgj代表第j个基因与各miRNA之间配对的数目，即基因j-miRNA的数目；rmi代表第i个miRNA相对于第j个基因的归一化评分排位，且rgj代表第j个基因相对于第i个miRNA的归一化评分排位。