[发明专利]DNA序列的快速并且安全的检索方法、装置及存储介质有效
| 申请号： | 201480029612.1 | 申请日： | 2014-04-30 |
| 公开（公告）号： | CN105229651B | 公开（公告）日： | 2018-10-19 |
| 发明（设计）人： | T·伊格纳坚科 | 申请（专利权）人： | 皇家飞利浦有限公司 |
| 主分类号： | G06F19/22 | 分类号： | G06F19/22;G06F19/28 |
| 代理公司： | 永新专利商标代理有限公司 72002 | 代理人： | 李光颖;王英 |
| 地址： | 荷兰艾*** | 国省代码： | 荷兰;NL |
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| 摘要： |
从序列索引检索序列模型。所述序列模型对被存储在数据库中的DNA或RNA序列进行建模，并且每个均包括有限内存树源模型和针对所述有限内存树源模型的参数。基于所检索的序列模型到查询DNA或RNA序列的拟合，来将被存储在所述数据库中的一个或多个DNA或RNA序列识别为最相似于所述查询DNA或RNA序列。所述序列模型可以为上下文树加权(CTW)模型 |
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| 搜索关键词： | dna 序列 快速 并且 安全 检索 | ||
【主权项】：
1.一种非暂态存储介质，其存储能够由电子数据处理设备(30)运行的指令，以执行包括以下的方法：生成序列索引(20)，所述序列索引包括针对被存储在数据库(28)中的脱氧核糖核酸(DNA)或核糖核酸(RNA)序列的序列模型，所述生成包括计算作为有限内存树源模型的针对被存储在所述数据库中的每个DNA或RNA序列的所述序列模型和针对所述有限内存树源模型的参数，其中，所述序列模型是使用上下文树加权(CTW)来计算的；并且基于将所述序列模型应用到查询DNA或RNA序列(40)并且基于确定每个序列模型如何好地拟合所述查询DNA或RNA序列，来将被存储在所述数据库中的一个或多个DNA或RNA序列识别为最相似于所述查询DNA或RNA序列。
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