[发明专利]评估生物外源性物质代谢扰动的系统和方法

摘要

提出了评估由于暴露至动因引起目标生物组织扰动的系统和方法。根据一组对比数据和目标生物组织和替代生物组织中的生物外源性物质代谢的计算因果网络模型，确定表示目标生物组织的扰动的一组得分。计算因果网络模型包括由边连接的可测节点和骨干节点，骨干节点和可测节点的每一个表示与生物外源性物质代谢有关的生物活动。边表示相连的节点之间的因果关系，其中根据与相应骨干节点连接的可测节点的活动度量确定相应骨干节点的活动值。所述的一组对比数据包括从暴露于动因下的替代生物组织的样本中获得的可测节点的活动度量和从暴露于对照下的替代生物组织的样本中获得可测节点的活动度量两者之间的区别。使用所述的对比数据对骨干节点计算一组数值以确定一组得分。所述的骨干节点的一组数值表示由于动因引起的替代生物组织的扰动，对从替代生物组织中获得的骨干节点的一组数值和表示目标生物组织扰动的一组得分之间的相关性进行确定。

主权项

1.一种计算方法，用于对哺乳动物来源的目标生物组织由于暴露于动因引起的扰动进行评估，所述方法包括：根据以下项确定表示目标生物组织的扰动的一组得分：(a)目标生物组织和替代生物组织中生物外源性物质代谢的计算因果网络模型，所述模型包括由边连接的可测节点和骨干节点，骨干节点和可测节点各自表示与生物外源性物质代谢有关的生物活动，边表示相连节点之间的因果关系，其中相应骨干节点的活动值由与相应骨干节点连接的可测节点的活动度量确定；及(b)包含从暴露于动因的替代生物组织样本中获得的可测节点的活动度量和从暴露于对照的替代生物组织样本中获得的可测节点的活动度量之间的区别的一组对比数据，其中，确定表示目标生物组织的扰动的一组得分包括：(i)在第一处理器使用所述一组对比数据和所述计算因果网络模型来计算骨干节点的一组得分，其中所述骨干节点的一组得分表示由于动因引起的替代生物组织的扰动，并且所述骨干节点的一组得分对应于骨干节点的活动值；(ii)识别从替代生物组织中获得的骨干节点的一组得分和表示目标生物组织的扰动的一组得分之间的相关性，其中，通过确定生物外源性物质代谢的计算因果网络模型对于响应于动因的目标生物组织的扰动和响应于动因的替代生物组织的扰动两者均是适用的，从而识别相关性；以及(iii)使用相关性和从替代生物组织中获得的骨干节点的一组得分来推断得到表示目标生物组织的扰动的一组得分。