[发明专利]用于比对序列的方法和系统有效
| 申请号： | 201480055430.1 | 申请日： | 2014-08-21 |
| 公开（公告）号： | CN105637098B | 公开（公告）日： | 2021-04-30 |
| 发明（设计）人： | 丹尼斯·库拉尔 | 申请（专利权）人： | 七桥基因公司 |
| 主分类号： | G16B30/10 | 分类号： | G16B30/10;G16B20/40;G16B20/50;G16B20/10;G16B20/20;G16B25/10 |
| 代理公司： | 北京柏杉松知识产权代理事务所(普通合伙) 11413 | 代理人： | 王春伟;刘继富 |
| 地址： | 美国马*** | 国省代码： | 暂无信息 |
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| 摘要： | 本发明包含用于比对读数(例如，核酸读数、氨基酸读数)与参考序列构建物的方法、用于构建该参考序列构建物的方法、以及使用该比对方法和该构建物以产生序列的系统。该方法是可扩展的，并且可以用来比对数百万读数与数千碱基或氨基酸长度的构建物。本发明另外包含用于基于核酸读数与该构建物中的位置的比对来识别疾病或基因型的方法。 | ||
| 搜索关键词： | 用于 序列 方法 系统 | ||
【主权项】：
一种用于比对多个序列读数的系统，其包括处理器和非暂时性存储器，其中所述存储器包括指令，所述指令当被执行时致使所述处理器：获取作为成串符号的多个序列读数；比较对应于序列读数的每串符号与参考序列构建物中的多个位置，其中所述构建物在所述构建物中的多个位置处包括至少两个不同串符号，对对应于序列读数的每串符号与所述参考序列构建物中的所述多个位置中的每一个位置之间的重叠进行评分，其中更高得分对应于更大重叠量；识别对应于每个序列读数的最高得分的所述重叠；将每个序列读数指派到所述构建物上对应于所述最高得分的位置；以及将对应于每个已比对序列读数的位置的文件写入到存储器。
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