[发明专利]用于检测和校正实时PCR信号中的跳跃的方法和系统

摘要

提供了用于检测和可能校正来自生长过程的数据中的跳跃误差或使其无效的系统、方法和装置。可以通过测定数据集的二阶导数并鉴定在二阶导数中具有相反符号的两个连续循环而鉴定跳跃误差。一旦已经检测到跳跃误差，则可以基于各种标准校正数据集或使其无效。是否无效或校正可以基于绝对跳跃高度、相对跳跃高度(例如，相对于净生长或相对于基线)、跳跃的绝对位置(循环数)或相对位置。在一种实施方式中，可以通过从跳跃后的点减去跳跃高度或通过将跳跃高度添加至跳跃前的点而校正跳跃。

主权项

1.检测PCR(聚合酶链式反应)生长过程的PCR扩增曲线中的跳跃误差的方法，所述方法包括：‑ 在计算机系统接收代表PCR扩增曲线的数据集，所述数据集包括多个数据点，每个数据点具有循环数和所述PCR生长过程在所述循环数的信号强度的一对坐标值；‑ 通过所述计算机系统计算内核与所述数据集的离散卷积，以获得所述数据集在所述循环数的二阶导数；‑ 鉴定两个连续循环数是否对于具有不同符号的二阶导数具有值；‑ 当第一循环数和第二循环数分别对于具有不同符号的二阶导数具有第一值和第二值时，确定所述第一值和所述第二值中的至少一个的大小是否大于阈值；并且‑ 基于确定所述第一值和所述第二值中的至少一个的大小大于所述阈值来鉴定在代表所述PCR扩增曲线的数据集中已经发生跳跃误差。