[发明专利]蛋白质分类模型构建方法和装置有效
| 申请号： | 201510001626.9 | 申请日： | 2015-01-05 |
| 公开（公告）号： | CN104794370B | 公开（公告）日： | 2018-07-13 |
| 发明（设计）人： | 刘伟;孙志强;宫二玲 | 申请（专利权）人： | 中国人民解放军国防科学技术大学 |
| 主分类号： | G06F19/12 | 分类号： | G06F19/12;G06F19/18 |
| 代理公司： | 长沙智嵘专利代理事务所 43211 | 代理人： | 黄子平 |
| 地址： | 410073 湖*** | 国省代码： | 湖南;43 |
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| 摘要： | 本发明提供了一种蛋白质分类模型构建方法和装置，蛋白质分类模型构建方法，包括：获取组织表达蛋白质分类特征；根据分类特征得到组织特异表达蛋白质的预测模型；以及根据预测模型对蛋白质进行分类。本发明提供的方法在采集基因表达数据的情况下，还采集了基因表达蛋白的其他特征，通过构建阴性集和阳性集后对其进行显著性分类，通过贝叶斯分类器可以获取预测结果的可靠性打分，以及综合的注释信息。 | ||
| 搜索关键词： | 蛋白质分类 方法和装置 模型构建 预测模型 构建 蛋白质 采集 贝叶斯分类器 基因表达蛋白 基因表达数据 组织特异表达 分类模型 分类特征 预测结果 种蛋白质 注释信息 显著性 分类 阴性 | ||
【主权项】：
1.一种蛋白质分类模型构建方法，其特征在于，包括：获取组织表达蛋白质分类特征；根据所述分类特征得到组织特异表达蛋白质的预测模型；以及根据所述预测模型对蛋白质进行分类；获取组织表达蛋白质的分类特征包括：查询组织特异表达的蛋白质，得到标准阳性数据集；查询组织广泛表达的蛋白质，得到标准阴性数据集；计算所述标准阳性数据集和所述标准阴性数据集中蛋白质间差异显著性；提取在所述标准阳性数据集和所述标准阴性数据集中具有蛋白质间差异显著性的特征作为分类特征。
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G06 计算；推算；计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学，即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真，例如：概率模型或动态模型，遗传基因管理网络，蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的，例如：进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的，例如：结构排序，结构或功能关系，蛋白质折叠，结构域拓扑，用结构数据的药靶，涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的，例如：基因型–表型关联，不均衡连接，种群遗传学，结合位置鉴定，变异发生，基因型或染色体组的注释，蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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