[发明专利]日本血吸虫线粒体分子标记及其应用有效
| 申请号： | 201510061854.5 | 申请日： | 2015-02-05 |
| 公开（公告）号： | CN105986016B | 公开（公告）日： | 2021-07-27 |
| 发明（设计）人： | 胡薇;徐斌;冯正;殷明波;李鸿雁;郑鸿翔;莫筱瑾 | 申请（专利权）人： | 中国疾病预防控制中心寄生虫病预防控制所;复旦大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6888 | 分类号： | C12Q1/6888;C12N15/11 |
| 代理公司： | 上海一平知识产权代理有限公司 31266 | 代理人： | 崔佳佳;陆凤 |
| 地址： | 200025 *** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | 本发明提供了一种日本血吸虫线粒体分子标记及其应用。具体地，本发明公开了一种基于ND1、ND4、和16S‑12S rDNA基因序列的聚类分析结果，从而鉴定日本血吸虫(Schistosoma japonicum katsurada)样本地域株、和/或对日本血吸虫样本进行地域性种群聚类的方法。本发明方法简便、准确，且稳定性高，对于鉴定血吸虫病患者的原始感染地，判断病例是原发型还是输入型有很大帮助。也为日本血吸虫病的监测和流行现状的研究提供了支持。 | ||
| 搜索关键词： | 日本 血吸虫 线粒体 分子 标记 及其 应用 | ||
【主权项】：
一种鉴定日本血吸虫(Schistosoma japonicum katsurada)样本地域株、和/或对日本血吸虫样本进行地域性种群聚类的方法，其特征在于，包括步骤：(i)对一个和/或多个样本中以下三种线粒体基因进行测序：NADH脱氢酶1(ND1)、NADH脱氢酶4(ND4)、和16S‑12S rDNA基因；(ii)将步骤(i)中的测序结果与日本血吸虫标准数据库中的地域株参考序列信息进行多序列联配，并利用所获的比对信息进行聚类分析；(iii)根据(ii)中的聚类分析结果获得所述样本的地域株鉴定结果、和/或所述样本地域性种群的聚类结果。
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