[发明专利]适用于三维脑组织高分辨海量图集的数据快速归档方法

摘要

本发明涉及一种适用于三维脑组织高分辨海量图集的数据快速归档方法，包括以下步骤：生成归档数据：将三维数据空间分割为若干大小相等数据块，并以n+1种不同分辨率生成n+1套数据集，各自根据路径自索引结构保存为独立数据文档；提取归档数据：通过感兴趣区域的起始坐标和终止坐标以及第几级分辨率6个参数，计算出包含所述感兴趣区域所需的最少数据块；依次将感兴趣区域所需的数据块的独立数据文档读入内存，并与保留感兴趣区域的数据点组成感兴趣的数据空间。本发明对三维脑组织高分辨海量图集进行归档，无需索引文件便可从归档文件中快速、连续调取出感兴趣数据块。本发明中建立和提取文档过程具有并行性，可以通过应用并行计算作进一步加速。

主权项

1.一种适用于三维脑组织高分辨海量图集的数据快速归档方法，其特征在于包括以下步骤：1） 生成归档数据：将三维数据空间分割为由若干大小相等数据块，所组成的数据集D0，每个数据块的尺寸为x、y、z；将所述三维数据空间进行等比例三维采样，分割为由若干大小相等数据块所组成的低分辨数据集D1，每个数据块的尺寸也为x、y、z；由此类推，进行n次等比例三维采样，获得n+1套具有不同分辨率水平的数据集D0、D1、D2、D3…Dn，组成每个数据集的数据块的尺寸均为x、y、z；将所有数据块保存为独立数据文档，所述的独立的数据文档所采用的格式为三维图像存储格式，并根据路径自索引结构进行存储；所述的自索引结构为一种四层路径结构，每一层定义为：第一层为根目录；第二层为分辨率等级，用文件夹名称区分；第三层为Z方向，即原三维图集轴向的块索引号，用文件夹名称区分；第四层为X或Y方向的块索引号，用文件夹名称区分，每个文件夹中包含相关的数据块所对应的数据文档，文档名中包含X、Y和Z的块索引编号；建立参数文件，参数文件记录原始数据体素分辨率，每块数据块的尺寸，每次采样的倍数；2） 提取归档数据：通过参数文件所提供的体素分辨率、数据块尺寸、采样倍数的信息，所需感兴趣区域的X、Y、Z的起始坐标和终止坐标，以及所需分辨率等级数这6组参数，计算出包含所述感兴趣区域所需的最少数据块；依次将感兴趣区域所需的数据块的独立数据文档读入内存，但仅保留感兴趣区域的数据点；所有保留在内存中的数据点与读入内存的数据块的独立数据文档组成感兴趣的数据空间。