[发明专利]一种用于检测LEPR基因245bpdeletion可变剪接体的引物、试剂盒及检测方法有效
申请号: | 201510077497.1 | 申请日: | 2015-02-13 |
公开(公告)号: | CN104673912B | 公开(公告)日: | 2017-03-29 |
发明(设计)人: | 刘小军;王丹丹;徐春林;李转见;王台安;蒋瑞瑞;闫峰宾;康相涛 | 申请(专利权)人: | 河南农业大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12N15/11 |
代理公司: | 郑州天阳专利事务所(普通合伙)41113 | 代理人: | 聂孟民 |
地址: | 450002*** | 国省代码: | 河南;41 |
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摘要: | 本发明涉及检测LEPR基因245bp deletion可变剪接体的引物以及包含该引物的试剂盒及检测方法,解决程序繁琐、耗时长、准确率低的问题,以待测cDNA为模板,引物对ACTB为引物,实时荧光定量PCR扩增ACTB内参基因,以引物对P为引物,实时荧光定量PCR扩增,荧光定量PCR扩增的反应体系由2×SYBR®Premix Ex TaqTM、去RNA酶的超纯水、引物P‑F或ACTB‑F、引物P‑R或ACTB‑R、cDNA模板构成,反应方法是预变性、变性、退火、延伸;对qPCR实时监测结果进行分析,用2‑△CT相对定量的方法计算,用SPSS version 20.0进行差异显著性检验,本发明准确、快速、方便,适用性强。 | ||
搜索关键词: | 一种 用于 检测 lepr 基因 245 bpdeletion 可变 剪接 引物 试剂盒 方法 | ||
【主权项】:
一种检测LEPR基因245bp deletion可变剪接体的的方法,其特征在于,包括以下步骤:(1)以待测cDNA为模板,以引物对ACTB为引物,实时荧光定量PCR扩增ACTB内参基因,以引物对P为引物,实时荧光定量PCR扩增鹌鹑的LEPR基因245bp deletion可变剪接体,所述的荧光定量PCR扩增的反应体系包括有2×SYBR®Premix Ex TaqTM Ⅱ9~11μL,去RNA酶的超纯水7~8μL,引物P‑F或ACTB‑F0.5~1μL,引物P‑R或ACTB‑R0.5~1μL,cDNA模板0.5~1.5μL,其反应方法是92~96℃预变性4~6min,92~96℃变性8~12s,55~65℃退火25~35 s,70~74℃延伸25~35s,35~45个循环;检测LEPR基因245bp deletion可变剪接体的引物,是针对鹌鹑LEPR基因mRNA水平245bp缺失后的部分第9外显子和第11外显子连接处的序列‑TGTGAACGATCGCGAGCAA‑设计识别该可变剪接体的特异性引物P‑R;在第9外显子上设计该可变剪接体的上游引物P‑F,引物对P只能扩增有245bp缺失的剪接体,从而避开其他已知或未知LEPR基因可变剪接体的干扰;所述的引物对P为:上游引物,P‑F:5’‑ TCCCTACCAAGATGCTGAC ‑3’;下游引物,P‑R:5’‑ TTGCTCGCGATCGTTCACA ‑3’;所述的引物对ACTB为:上游引物,ACTB‑F:5’‑ GAGAGAAGATGACACAGAC ‑3’;下游引物,ACTB‑R:5’‑ GTCCATCACAATACCAGTGG ‑3’;(2)对步骤(1)的荧光定量PCR实时监测结果进行扩增曲线和熔解曲线分析,采用 2‑△CT相对定量的方法计算,用SPSS version 20.0进行差异显著性检验。
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