[发明专利]基于高通量RNAi筛选HIV-1活性的决定因子的方法在审

专利信息
申请号: 201510107692.4 申请日: 2015-03-12
公开(公告)号: CN106032550A 公开(公告)日: 2016-10-19
发明(设计)人: 卢洪州;蒋卫民 申请(专利权)人: 上海市公共卫生临床中心
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12Q1/66;C12Q1/02;C12N15/867
代理公司: 上海元一成知识产权代理事务所(普通合伙) 31268 代理人: 吴桂琴
地址: 201508 上*** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明属分子生物学技术领域,具体涉及基于高通量RNAi筛选HIV-1活性的决定因子的方法。本发明针对474个激酶的shRNA文库高通量RNAi筛选技术在HEK293T中稳定表达HIV-1 LTR-hRluc/HSVTK-hLuc荧光素酶双重报告质粒,hRluc表达荧光强度的HIV-1 LTR相对转录活性除以hLuc的荧光强度,获得由激酶参与的HIV-1 LTR调节转录活性;本发明的方法,其针对人激酶基因,进行功能性沉默筛查,寻找与HIV复制相关宿主因子,为进一步理解HIV与宿主之间的相互作用,以及寻找抗HIV感染的潜在治疗靶点提供了有价值的参考依据。
搜索关键词: 基于 通量 rnai 筛选 hiv 活性 决定 因子 方法
【主权项】:
基于高通量RNAi筛选HIV‑1活性的决定因子的方法,其特征在于,其包括步骤:(1)制备人激酶(Kinase)shRNA慢病毒文库;(2)筛选:慢病毒文库感染293T HIV 5'LTR‑luciferase稳定株,感染后96h进行luciferase检测;(3)数据分析,确定阳性基因;(4)有效shRNA靶点确认:独立包装阳性基因的4个shRNA慢病毒,Luciferase和qPCR实验确定有效shRNA靶点;(5)选取阳性基因进行功能研究。
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