[发明专利]一种交联二肽快速鉴定方法有效
申请号: | 201510112890.X | 申请日: | 2015-03-16 |
公开(公告)号: | CN106033501B | 公开(公告)日: | 2018-11-30 |
发明(设计)人: | 孟佳明;樊盛博;迟浩;卢珊;孙瑞祥;董梦秋;贺思敏 | 申请(专利权)人: | 中国科学院计算技术研究所 |
主分类号: | G06F19/18 | 分类号: | G06F19/18 |
代理公司: | 北京泛华伟业知识产权代理有限公司 11280 | 代理人: | 王勇;李科 |
地址: | 100190 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明提供一种交联二肽快速鉴定方法,包括:1)提取待鉴定串联谱图中的有效谱峰,根据各个有效谱峰对应的质量,查找碎片索引得到相应的肽段序列作为候选α肽序列,其中所述碎片索引记录了各个碎片质量及其对应的肽段序列;2)对于每个候选α肽序列,根据所述待鉴定串联谱图的母离子质量计算相应的β肽质量,进而得到相应的候选β肽序列,将候选α肽序列和相应的候选β肽序列组合得到候选交联二肽;3)将步骤2)所得的候选交联二肽与串联谱图进行精细匹配,得出鉴定结果。本发明不需使用特殊交联剂;搜索速度快,鉴定效率高;搜索灵敏度高。 | ||
搜索关键词: | 一种 交联 二肽 快速 鉴定 方法 | ||
【主权项】:
1.一种交联二肽快速鉴定方法,其特征在于,包括下列步骤:1)提取待鉴定串联谱图中的有效谱峰,根据各个有效谱峰对应的质量,查找碎片索引得到相应的肽段序列作为候选α肽序列,其中所述碎片索引记录了各个碎片质量及其对应的肽段序列;2)对于每个候选α肽序列,根据所述待鉴定串联谱图的母离子质量计算相应的β肽质量,进而得到相应的候选β肽序列,将候选α肽序列和相应的候选β肽序列组合得到候选交联二肽;3)将步骤2)所得的候选交联二肽与串联谱图进行精细匹配,得出鉴定结果。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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