[发明专利]土壤中植物病原菌含量的检测方法有效
申请号: | 201510122856.0 | 申请日: | 2015-03-19 |
公开(公告)号: | CN104694658B | 公开(公告)日: | 2017-07-14 |
发明(设计)人: | 张力群;郭松;张俊威;陈伟 | 申请(专利权)人: | 中国农业大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68;C12Q1/06;C12N15/10;C12R1/645 |
代理公司: | 北京纪凯知识产权代理有限公司11245 | 代理人: | 关畅,任凤华 |
地址: | 100193 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 本发明公开了土壤中植物病原菌含量的检测方法。本发明所提供的土壤中植物病原菌含量的检测方法包括包括S1)和S2)S1)用提取土壤微生物DNA的方法提取待测土壤微生物DNA,得到待测土壤微生物DNA;S2)以待测土壤微生物DNA为模板,用鉴定植物病原菌的成套试剂进行荧光定量PCR,通过PCR产物的荧光强度确定待测土壤中植物病原菌的含量;提取土壤微生物DNA的方法包括S21)和S22)S21)向土壤中加入提取缓冲液得到细胞悬液;S22)向细胞悬液中加入SDS得到细胞裂解液,所述细胞裂解液中的SDS的质量百分比浓度为4%,裂解细胞,得到裂解液;除去所述裂解液中的杂质得到所述待测土壤微生物DNA。 | ||
搜索关键词: | 土壤 植物 病原菌 含量 检测 方法 | ||
【主权项】:
土壤中植物病原菌含量的检测方法,包括如下S1)和S2):S1)、用提取土壤微生物DNA的方法提取待测土壤微生物DNA,得到待测土壤微生物DNA;S2)、以所述待测土壤微生物DNA为模板,用鉴定植物病原菌的成套试剂进行荧光定量PCR,通过PCR产物的荧光强度确定所述待测土壤中所述植物病原菌的含量;所述鉴定植物病原菌的成套试剂由鉴定所述植物病原菌的PCR引物对和探针组成;所述PCR引物对由序列表中SEQ ID No.1所示的单链DNA和SEQ ID No.2所示的单链DNA组成;所述探针的核苷酸序列如序列表中SEQ ID No.3所示;S1)所述提取土壤微生物DNA的方法包括如下S21)和S22)的步骤:S21)向所述土壤中加入提取缓冲液得到细胞悬液;S22)向所述细胞悬液中加入SDS得到细胞裂解液,所述细胞裂解液中的SDS的质量百分比浓度为4%,裂解细胞,得到裂解液;除去所述裂解液中的杂质得到所述待测土壤微生物DNA;所述提取缓冲液由溶剂和溶质组成;所述溶剂为磷酸缓冲液,所述溶质及其浓度为1M Tris‑HCl、0.1M EDTA、1.5M NaCl、质量百分比浓度为2%的CTAB、质量百分比浓度为2%PVP;所述磷酸缓冲液由溶质和溶剂组成的缓冲液,所述溶剂为水,所述溶质为NaH2PO4和Na2HPO4,所述NaH2PO4在所述磷酸缓冲液中的浓度为6.8mM,所述Na2HPO4在所述磷酸缓冲液中的浓度为93.2mM,所述磷酸缓冲液的pH为8.0;S21)包括下述S21a)和S21b):S21a)向所述土壤中加入所述提取缓冲液得到土壤悬液;所述土壤的量为100g;S21b)破碎所述土壤悬液中的土壤颗粒得到所述细胞悬液;S21a)中所述土壤悬液中土壤颗粒的直径在50微米以下;S21b)中所述破碎所述土壤悬液中的土壤颗粒为德国Retsch生产的PlanetaryBall Mill PM400仪器处理所述土壤悬液;所述处理的时间为5‑20分钟;所述植物病原菌为十字花科根肿病菌。
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