[发明专利]EST-SSR标记引物组合及筛选方法在豌豆矮生、蔓生种质遗传多样性分析上的应用

摘要

本发明公开了一种EST-SSR标记引物组合，包括12对EST-SSR可用引物，EST-SSR标记引物组合筛选方法的步骤包括豌豆转录组测序获得的EST序列中SSR位点筛选、引物设计、PCR扩增、产物毛细管电泳检测、标记筛选，并将该EST-SSR标记引物组合应用与豌豆矮生、蔓生类型种质遗传多样性分析，本发明提供的EST-SSR标记组合，有助于快速、准确地辨析菜用豌豆不同类型种质材料，分析其亲缘关系，为该物种的定向育种奠定基础。

主权项

一种用于菜用豌豆矮生、蔓生类型种质遗传多样性分析的EST‑SSR标记组合，其特征在于，包括12 对EST‑SSR可用引物，引物名称及序列分别为：PeaNsat‑001，    s:5’‑ TTGGAGACGGCATAACC‑3’，a:5’‑   CCTTGCTTGGAGGAACT‑3’；PeaNsat‑004，    s:5’‑ CACAGAATGGGTTGAG‑3’，a:5’‑   GTGGGGTTTGGATAGT‑3’ ；PeaNsat‑021，    s:5’‑ ATGGAGCGGAGGAGTTGG‑3’，a:5’‑   CGATGATGCTGCGTTCTT‑3’ ；PeaNsat‑022，    s:5’‑ TCTTCACGCCTAAAACTC‑3’，a:5’‑   AACCGAAACGAAATCAC‑3’ ；PeaNsat‑029，    s:5’‑ GAGACAATGATGGAACAAG‑3’，a:5’‑   TGCCAAACTGACAGACAAA‑3’ ；PeaNsat‑031，    s:5’‑ CTTAGTTTGCGACCAGC ‑3’，a:5’‑   CGTGAACGGAAGGACAT‑3’ ；PeaNsat‑083，    s:5’‑ TGTTGAGAAGCGTGAATG ‑3’，a:5’‑    CTCTTTTGGCTGGGATTA ‑3’ ；PeaNsat‑095，    s:5’‑ AGTGGAAGGAGATGAACA ‑3’，a:5’‑    CTAATGGAAGGGGTAGAG ‑3；PeaNsat‑100，    s:5’‑ AAACCAAAACCACCCTAC ‑3’，a:5’‑   TTAGACTCAGAGCCAAATC ‑3’ ；PeaNsat‑113，    s:5’‑ GCAACCTCGTCGCAAAAC ‑3’，a:5’‑   GCCGAAGATGAAGATGGA ‑3’ ；PeaNsat‑124，    s:5’‑ TTCCAGTAACCAACACCG ‑3’，a:5’‑   CAATTTCCCAAACACTACAC；PeaNsat‑125，    s:5’‑ TGGCTTCACTGATACCTT ‑3’，a:5’‑   TCCACTGTTTTCTCCTCC ‑3’ 。