[发明专利]一种适合IonTorrent测序平台的16SrRNA测序方法在审
申请号: | 201510238631.1 | 申请日: | 2015-05-12 |
公开(公告)号: | CN106282316A | 公开(公告)日: | 2017-01-04 |
发明(设计)人: | 毛伟华 | 申请(专利权)人: | 浙江大学 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 杭州赛科专利代理事务所(普通合伙)33230 | 代理人: | 冯年群 |
地址: | 310027*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | 本发明属于生物技术领域,更具体地说,涉及一种针对Ion Torrent高通量测序平台的Ion Torrent 16S rRNA测序引物设计、建库及高通量测序的方法,其包括样本DNA提取、16S rRNA测序引物设计、16S rRNA PCR 扩增、PCR 扩增产物纯化及定量、测序文库构建、高通量测序和序列分析,本发明的有益效果是:本发明的方法具有如下优点:(1)样品标记简单,(2)建库方法简单,(3)极大地降低测序成本,(4)位点选择灵活,(5)数据分析容易,非常适合中等数量样本的检测。 | ||
搜索关键词: | 一种 适合 iontorrent 平台 16 srrna 方法 | ||
【主权项】:
一种适合Ion Torrent 测序平台的16S rRNA测序方法,其包括样本DNA提取、16S rRNA测序引物设计、16S rRNA PCR 扩增、PCR 扩增产物纯化及定量、测序文库构建、高通量测序和序列分析,其特征在于:所述16S rRNA测序引物设计按如下步骤进行:(1)选取16S rRNA通用引物;(2)选取Ion Torrent 测序平台DNA 1‑96 barcode 序列;(3)在PCR 上游引物5’端加上barcode 序列,得到Ion Torrent 16S rRNA测序上游引物,在PCR 下游引物5’端加上同样的barcode 序列,得到Ion Torrent 16S rRNA测序下游引物。
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