[发明专利]一种适合IonTorrent测序平台的16SrRNA测序方法在审

专利信息
申请号: 201510238631.1 申请日: 2015-05-12
公开(公告)号: CN106282316A 公开(公告)日: 2017-01-04
发明(设计)人: 毛伟华 申请(专利权)人: 浙江大学
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68
代理公司: 杭州赛科专利代理事务所(普通合伙)33230 代理人: 冯年群
地址: 310027*** 国省代码: 浙江;33
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摘要: 发明属于生物技术领域,更具体地说,涉及一种针对Ion Torrent高通量测序平台的Ion Torrent 16S rRNA测序引物设计、建库及高通量测序的方法,其包括样本DNA提取、16S rRNA测序引物设计、16S rRNA PCR 扩增、PCR 扩增产物纯化及定量、测序文库构建、高通量测序和序列分析,本发明的有益效果是:本发明的方法具有如下优点:(1)样品标记简单,(2)建库方法简单,(3)极大地降低测序成本,(4)位点选择灵活,(5)数据分析容易,非常适合中等数量样本的检测。
搜索关键词: 一种 适合 iontorrent 平台 16 srrna 方法
【主权项】:
一种适合Ion Torrent 测序平台的16S rRNA测序方法,其包括样本DNA提取、16S rRNA测序引物设计、16S rRNA PCR 扩增、PCR 扩增产物纯化及定量、测序文库构建、高通量测序和序列分析,其特征在于:所述16S rRNA测序引物设计按如下步骤进行:(1)选取16S rRNA通用引物;(2)选取Ion Torrent 测序平台DNA 1‑96 barcode 序列;(3)在PCR 上游引物5’端加上barcode 序列,得到Ion Torrent 16S rRNA测序上游引物,在PCR 下游引物5’端加上同样的barcode 序列,得到Ion Torrent 16S rRNA测序下游引物。
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