[发明专利]肿瘤诊断标志物的筛选方法、以该方法获得的乳腺癌肺转移相关基因及其应用

摘要

本发明涉及肿瘤诊断标志物的筛选方法、以该方法获得的乳腺癌肺转移相关基因及其应用。本发明人采用新的生物信息学分析思路和方法，结合已有的分析工具，提供了一种新型的肿瘤标志物的筛选方法，该方法可用于从总体上分析疾病发生或导致疾病进展的关键性基因，对于多基因性疾病的分析特别适用。

主权项

1.一种多基因性疾病标志物的筛选方法，其特征在于，肿瘤为乳腺癌肺转移；所述方法由以下步骤组成：(1)提供一组预后已知的多基因性疾病患者疾病组织的基因表达谱，其中包括n例患者的m个基因的表达谱；其中n是大于10的正整数，m是大于100的正整数；以表达谱中每一基因的表达量为基础，分别将n例患者划分为基因高表达组和基因低表达组，分别比较针对每一基因所分成的两组患者的疾病预后情况，发生统计学上差异的则认为该基因的高或低表达与相关预后有关联，获得一系列与相关预后有关联的基因；(2)对(1)获得的一系列与相关预后有关联的基因进行Pathway分析，获得这些基因的相互作用模式，确定在相互作用模式中处于关键节点的基因；(3)(2)获得的处于关键节点的基因构成乳腺癌肺转移标志物的组合；所述的乳腺癌肺转移标志物的组合为：FOXA1，HIF1A，EGFR，IL8和JUND的组合。