[发明专利]rtPASA用于检测棉蚜种群等位基因突变频率的方法在审
申请号: | 201510313711.9 | 申请日: | 2015-06-10 |
公开(公告)号: | CN105063179A | 公开(公告)日: | 2015-11-18 |
发明(设计)人: | 张靖;芮昌辉;崔丽;徐希宝;任龙;齐浩亮 | 申请(专利权)人: | 中国农业科学院植物保护研究所 |
主分类号: | C12Q1/68 | 分类号: | C12Q1/68 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 100193 北京市海淀区圆明园西*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | 一种用于棉蚜种群nAChR beta1等位基因突变频率快速检测的rtPASA方法,特异性rtPASA引物设计时,等位特异性下游引物3’端固定于突变位点处,与242位点的碱基配对或错配,同时引物3’端倒数第三个碱基人为错配(G/C)。本发明通过改进在特异性引物中人为引入错配碱基,使其适用于突变位点G/C的检测。然后用设计的引物进行实时荧光定量等位特异性PCR反应,对棉蚜种群等位基因突变频率的检测,本发明的方法可靠,快速、灵敏度高、操作简便易行,实验费用低廉。 | ||
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【主权项】:
一种用于棉蚜等位基因点突变快速检测的实时荧光定量等位特异性PCR(rtPASA)方法,依次包括特异性引物设计、普通PCR扩增、实时荧光定量等位特异性反应、标准曲线制备等步骤,其特征在于:所述特异性rtPASA引物设计中,两条特异性下游引物3’端除设计于突变位点处以外,将引物3’端倒数第三个碱基人为错配,降低等位特异性引物扩增效率,提高其扩增的特异性,达到区分等位突变位点的目的。然后用设计的引物进行实时荧光定量PCR反应,用标准品构建标准曲线,用于快速检测未知样本等位基因突变频率。
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