[发明专利]一种快速检索病原物特异性检测靶标的方法在审
| 申请号： | 201510341295.3 | 申请日： | 2015-06-18 |
| 公开（公告）号： | CN105255998A | 公开（公告）日： | 2016-01-20 |
| 发明（设计）人： | 周泽扬;罗洁;潘国庆;杜孝田 | 申请（专利权）人： | 西南大学;重庆文理学院 |
| 主分类号： | C12Q1/68 | 分类号： | C12Q1/68 |
| 代理公司： | 四川君士达律师事务所 51216 | 代理人： | 芶忠义 |
| 地址： | 402160*** | 国省代码： | 重庆;85 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种快速检索病原物特异性检测靶标的方法。本发明的快速检索病原物特异性检测靶标的方法在基因组水平快速查找新型病原生物的物种特异基因，能够在较短的时间内建立病新型原物的特异地分子诊断，适用于突发疫病、新型变异病原物等病理学特征未知、传播途径未知等人们研究不深入的病原物的快速检测与诊断。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 快速 检索 原物 特异性 检测 靶标 方法 | ||
【主权项】：
一种快速检索病原物特异性检测靶标的方法，其特征在于，包括以下步骤：采集新型病原生物的样本，提取其基因组，构建基因组文库；通过NCBI的已发布的基因组信息，基于看家基因座位的保守性，进行染色体或者scaffold逐一对齐，同时进行共线性分析；检索出基因座位不保守的基因，并且通过比较基因组学分析确定其与GenBank库中不具有同源的基因序列作为候选基因；将候选基因在目的病原物基因组数据中进行检索，确定其上下游基因保守性，并单独建库；对候选基因进行克隆、测序、比对分析，并检测基因的表达情况；将验证正确，并且能够正常转录的基因确定为分子诊断的靶基因；收集多种形态各异的具有同一寄主的病原微生物，并将候选基因进行PCR检测，验证其特异性。
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