[发明专利]确定群体中受到选择作用的位点的方法和装置在审
| 申请号： | 201510358145.3 | 申请日： | 2015-06-25 |
| 公开（公告）号： | CN106326689A | 公开（公告）日： | 2017-01-11 |
| 发明（设计）人： | 陈伟芬;余胜;王莹;王崇志;何伟明 | 申请（专利权）人： | 深圳华大基因科技服务有限公司 |
| 主分类号： | G06F19/22 | 分类号： | G06F19/22 |
| 代理公司： | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙)11201 | 代理人： | 李志东 |
| 地址： | 518083 广东省深圳市*** | 国省代码： | 广东;44 |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | 本发明公开一种确定群体中受到选择作用的位点的方法，方法包括以下步骤：获得群体样本的核酸测序数据，群体样本来自一个物种的多个个体，群体样本能够依据n对预定指标分成2n个一级亚群体，n为自然数；基于核酸测序数据，检测以获得群体SNP数据，群体SNP数据包括多个一级亚群体SNP数据；基于群体SNP数据，比较不同一级亚群体的多态性的差异，以确定受到选择作用的SNP，受到选择作用的SNP即为所称的受到选择作用的位点。本发明还提供一种确定群体中受到选择作用位点的装置和系统。利用本发明的方法、装置和/或系统，能够准确判定出群体中受到选择作用的位点。 | ||
| 搜索关键词： | 确定 群体 受到 选择 作用 方法 装置 | ||
【主权项】：
一种确定群体中受到选择作用的位点的方法，所述选择作用包括人工选择作用和自然选择作用的至少一种，其特征在于，包括以下步骤：(1)获得群体样本的核酸测序数据，所述群体样本来自一个物种的多个个体，任选的，所述群体样本来自一个物种多个个体的相同组织或者一个物种的多个个体的相同部位，所述群体样本能够依据n对预定指标划分成2n个一级亚群体，n为自然数；(2)基于(1)中的核酸测序数据，检测以获得群体SNP数据，所述群体SNP数据包括多个一级亚群体SNP数据；(3)基于(2)中的群体SNP数据，比较不同一级亚群体的多态性的差异，以确定受到选择作用的SNP，所述受到选择作用的SNP为所述受到选择作用的位点。
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