[发明专利]一种免疫组库数据分析方法及终端有效

专利信息
申请号: 201510363037.5 申请日: 2015-06-26
公开(公告)号: CN105095687B 公开(公告)日: 2018-10-26
发明(设计)人: 贺建奎;童寅 申请(专利权)人: 南方科技大学
主分类号: G06F19/22 分类号: G06F19/22
代理公司: 广州三环专利商标代理有限公司 44202 代理人: 郝传鑫;熊永强
地址: 518000 广东省*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 发明实施例公开了一种免疫组库数据分析方法及终端,其中方法包括:接收针对第一样本的第一分析指令,该第一分析指令携带该第一样本的注释文件;响应该第一分析指令,根据该第一样本的注释文件,生成并输出针对该第一样本的整体分析图,该整体分析图包括V基因频率分布图、D基因频率分布图、J基因频率分布图、高克隆CDR3序列的频率分布图、CDR3的长度分布图、免疫多样性分析图、VDJ基因组合分析图、Ig链类型比例分布图和多Ig链类型共同序列分析图中的任意一种或多种分析图。可见,实施本发明实施例有利于对免疫组库的状况进行更全面的评估。
搜索关键词: 一种 免疫 数据 分析 方法 终端
【主权项】:
1.一种免疫组库数据分析方法,其特征在于,所述方法包括:接收用户输入的用于对第一样本的免疫组库数据进行注释的注释指令,所述注释指令携带包括所述第一样本的免疫组库数据的数据文件;响应所述注释指令,从所述数据文件中提取所述第一样本的免疫组库数据;将提取的所述第一样本的免疫组库数据与预先存储的预设免疫组库数据进行对比,从所述预设免疫组库数据中获取与所述第一样本的免疫组库数据相同的目标免疫组库数据;根据预先存储的与所述目标免疫组库数据对应的注释数据,生成所述第一样本的注释文件;接收针对第一样本的第一分析指令,所述第一分析指令携带所述第一样本的注释文件,所述注释文件包括所述第一样本的免疫组库数据的V基因种类、D基因种类、J基因种类、CDR3序列和Ig链的类型,所述第一样本的免疫组库数据包括多个TCR基因序列和/或多个BCR基因序列;响应所述第一分析指令,根据所述第一样本的注释文件,生成并输出针对所述第一样本的整体分析图,所述整体分析图包括V基因频率分布图、D基因频率分布图、J基因频率分布图、高克隆CDR3序列的频率分布图、CDR3的长度分布图、免疫多样性分析图、VDJ基因组合分析图、Ig链类型比例分布图和多Ig链类型共同序列分析图;接收用于对所述第一样本和第二样本进行免疫组库差异分析的第二分析指令,所述第二分析指令携带所述第一样本的注释文件与所述第二样本的注释文件,所述第二样本的注释文件包括所述第二样本的免疫组库数据的V基因种类、D基因种类、J基因种类、CDR3序列和Ig链的类型,所述第二样本的免疫组库数据包括多个TCR基因序列和/或多个BCR基因序列;响应所述第二分析指令,根据所述第一样本的注释文件与所述第二样本的注释文件,生成并输出针对所述第一样本和所述第二样本的差异分析图,所述差异分析图包括高克隆差异分析图、免疫多样性差异分析图、V、D和J基因使用频率差异分析图、共有序列分析图和主成分分析图中的任意一种或多种分析图。
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