[发明专利]一种BurrowsWheeler变换硬件处理装置

摘要

本发明公开了一种Burrows Wheeler变换（Burrows Wheeler Transform，简称BWT）硬件处理装置。该装置包括数据接收模块，用于接收待排序字符串；数据存储模块，用于存储待排序字符串及其序号；数据统计模块，用于统计出待排序字符串中相同字符的数量，以及每组相同字符中序号最小的字符的序号；BWT处理模块，利用数据统计模块统计出的信息，对存储在数据存储模块中的待排序字符串进行BWT排序；数据输出模块，暂存BWT排序完成的字符串及其主序号。相比现有技术，本发明可在提升BWT变换速度和效率的同时，降低对计算机处理器的占用率，提高能效。

主权项

一种Burrows Wheeler变换硬件处理装置，其特征在于，采用可编程逻辑器件实现，该装置包括：数据接收模块，用于接收待排序字符串；数据存储模块，用于存储待排序字符串及其序号；数据统计模块，用于统计出待排序字符串中相同字符的数量，以及每组相同字符中序号最小的字符的序号；BWT处理模块，利用数据统计模块统计出的信息，对存储在数据存储模块中的待排序字符串进行BWT排序；其包括：链表生成子模块，用于将每组中相同的字符的序号按照Burrows Wheeler变换中循环字符串排序规则进行进一步排序，并按照链表数据结构进行存储；基地址生成子模块，产生用于将每组字符存入排序存储子模块中所需的基地址；排序存储子模块，用于存储排序后的字符串；主序号生成子模块，记录整个BWT变换模块工作过程中，主元素在RAM中所处的位置，并将这个位置信息转化成用于BWT反变换的主序号；数据输出模块，暂存BWT排序完成的字符串及其主序号。