[发明专利]荧光标记偶氮修饰核苷酸及其在DNA测序中的用途在审

专利信息
申请号: 201510388164.0 申请日: 2015-07-03
公开(公告)号: CN105085591A 公开(公告)日: 2015-11-25
发明(设计)人: 沈玉梅;谭连江;邵志峰;龚兵;杨晴来;李小卫 申请(专利权)人: 上海交通大学
主分类号: C07H19/10 分类号: C07H19/10;C07H19/20;C07H1/00;C07C245/08;C09K11/06;C12Q1/68
代理公司: 上海汉声知识产权代理有限公司 31236 代理人: 郭国中;陈少凌
地址: 200240 *** 国省代码: 上海;31
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摘要: 发明公开了一种荧光标记偶氮修饰核苷酸及其在DNA测序中的用途;其结构式如式I所示:,其中,R1、R2、R3、R4、R5、R6不同时为H;m,n为0~10的整数。与现有技术相比,本发明合成了一类新的基于偶氮连接单元的可逆终端;用变性PAGE胶即测序胶证明,该类可逆终端在模板为连续多个相同碱基时,一次只能延伸一个可逆终端,且延伸效率为100%,在还原剂作用下,可实现高效快递完全剪切,具有应用于DNA测序的巨大潜力和价值;同时,其合成所需原料简单易得,合成过程均为常规化学反应,可用于大规模推广使用。
搜索关键词: 荧光 标记 偶氮 修饰 核苷酸 及其 dna 中的 用途
【主权项】:
一种基于偶氮连接单元的荧光标记核苷酸,其结构式如式I所示:其中,碱基选自U(或T)、C、A、G四个不同的碱基;荧光素选自BODIPY、罗丹明、香豆素、呫吨、花青、芘、酞菁、Alexa、Squaring染料、产生能量转移染料的组合以及其衍生物中的一种;R1、R2、R3、R4、R5、R6选自H、C2~C14的烷基、羧基、羧酸酯、羟基、PEG链、醚,且R1、R2、R3、R4、R5、R6不同时为H;m为0~10中的任一整数,n为0~10中的任一整数。
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