[发明专利]一种用于核酸单碱基改变的核酸反应理论分析方法

摘要

本发明涉及一种用于核酸单碱基改变的核酸反应理论分析方法，包括：(1)计算互补反应和错配反应的标准焓变化量ΔrH和标准熵变化量ΔrS；(2)穷举计算出所有单碱基改变的焓变化量ΔΔH与熵变化量ΔΔS，得到核酸单碱基改变的焓变化量与熵变化量数据表；(3)通过查阅上述数据表得到任意一种单碱基改变的焓变与熵变数据，同时计算出在任意温度和盐度下该单碱基改变引起的反应自由能变化量ΔΔG，从而指导核酸反应设计。本发明查表方便；使用简单；能够用于任何涉及单碱基改变的核酸反应理论分析；有望促进单碱基改变检测探针涉及以及其他核酸反应领域的理论分析与设计。

主权项

1.一种用于核酸单碱基改变的核酸反应理论分析方法，包括：(1)计算参与互补反应和错配反应中每一种核酸分子的标准焓ΔH与标准熵ΔS；并根据此计算出互补反应和错配反应的标准焓变化量ΔrH和标准熵变化量ΔrS；其中，核酸杂交反应方程式为：X+C→互补产物  1S+C→错配产物  2其中X代表与C完全互补核酸序列，S代表单碱基改变的靶序列；X与探针经过反应，生成完全互补的杂交双链，称该反应为反应1；则S与C的杂交反应称该反应为反应2，生成错配杂交产物；(2)两个反应的ΔrH和ΔrS分别相减，得到相应的单碱基改变引起的焓变化量ΔΔH与熵变化量ΔΔS；穷举计算出所有单碱基改变的焓变化量ΔΔH与熵变化量ΔΔS，得到核酸单碱基改变的焓变化量与熵变化量数据表；其中，ΔΔH为互补反应和错配反应之间的反应标准焓差，ΔΔS为互补反应和错配反应之间的反应标准熵差；(3)通过查阅上述数据表得到任意一种单碱基改变的焓变与熵变数据，同时计算出在任意温度和盐度下该单碱基改变引起的反应自由能变化量ΔΔG，从而指导核酸反应设计；其中，反应自由能变化量ΔΔG的计算公式为：ΔΔG＝ΔΔH‑TΔΔS，其中T为温度。