[发明专利]检测黄连分子标记多态性的物质在鉴定或辅助鉴定黄连属植物中的应用

摘要

本发明公开了检测黄连分子标记多态性的物质在鉴定或辅助鉴定黄连属植物中的应用。本发明所提供的应用中，黄连分子标记为下述A1‑A4A1以黄连属植物的基因组DNA为模板，采用引物对037A4进行扩增得到的DNA分子；A2以黄连属植物的基因组DNA为模板，采用引物对034H11进行扩增得到的DNA分子；A3以黄连属植物的基因组DNA为模板，采用引物对006G4进行扩增得到的DNA分子；A4以黄连属植物的基因组DNA为模板，采用引物对008H3进行扩增得到的DNA分子。实验证明，本发明的黄连分子标记037A4、034H11、006G4和008H3的多态性与黄连属植物的不同种相关，可用来鉴定黄连属植物。

主权项

4种分子标记在鉴定或辅助鉴定黄连属植物中的应用；所述分子标记，为下述A1‑A4：A1、以黄连属植物的基因组DNA为模板，采用引物对037A4进行扩增得到的DNA分子；所述引物对037A4为由SEQ ID No.1的第17‑40位所示的单链DNA和与SEQ ID No.1的第519‑538位反向互补的单链DNA组成的引物对；A2、以黄连属植物的基因组DNA为模板，采用引物对034H11进行扩增得到的DNA分子；所述引物对034H11为由SEQ ID No.2的第15‑36位所示的单链DNA和与SEQ ID No.2的第557‑576位反向互补的单链DNA组成的引物对；A3、以黄连属植物的基因组DNA为模板，采用引物对006G4进行扩增得到的DNA分子；所述引物对006G4为由SEQ ID No.3的第9‑30位所示的单链DNA和与SEQ ID No.3的第776‑795位反向互补的单链DNA组成的引物对；A4、以黄连属植物的基因组DNA为模板，采用引物对008H3进行扩增得到的DNA分子；所述引物对008H3为由SEQ ID No.4的第10‑32位所示的单链DNA和与SEQ ID No.4的第573‑595位反向互补的单链DNA组成的引物对；所述扩增为PCR扩增；所述A1的多态性为下述A11‑A13：A11为对应于SEQ ID No.1第433‑435位所述A1的核苷酸为GTA或TCC；A12为对应于SEQ ID No.1的第438‑440位所述A1的核苷酸为TCC或GTA；A13为对应于SEQ ID No.1的第430‑440位间所述A1的同源染色体相比较有或无核苷酸的替换；所述A2的多态性为下述A21‑A24：A21为对应于SEQ ID No.2的第154位所述A2的核苷酸为G或A；A22为对应于SEQ ID No.2的第285位和第286位间所述A2有或无核苷酸的插入；A23为对应于SEQ ID No.2的第359‑360位所述A2的核苷酸为CC或TT；A24为对应于SEQ ID No.2的第320‑330位间所述A2有或无核苷酸插入和/或删除，造成同源染色体对应核苷酸区段长度不同或相同；所述A3的多态性为下述A31‑A35：A31为对应于SEQ ID No.3的第254位所述A3的核苷酸为G或A；A32为对应于SEQ ID No.3的第286位所述A3的核苷酸为C或T；A33为对应于SEQ ID No.3的第225‑245位间所述A3有或无核苷酸插入和/或删除，造成同源染色体对应核苷酸区段长度不同或相同；A34为对应于SEQ ID No.3的第325‑345位间所述A3有或无核苷酸插入和/或删除，造成同源染色体对应核苷酸区段长度不同或相同；A35为对应于SEQ ID No.3的第31‑50位间所述A3有或无核苷酸插入和/或删除，造成同源染色体对应核苷酸区段长度不同或相同；所述A4的多态性为下述A41‑A43：A41为对应于SEQ ID No.4的第126位所述A4的核苷酸为A或G；A42为对应于SEQ ID No.4的第130‑150位间所述A4有或无核苷酸插入和/或删除，造成同源染色体对应核苷酸区段长度不同或相同；A43为对应于SEQ ID No.4的第220‑240位间所述A4有或无核苷酸插入和/或删除，造成同源染色体对应核苷酸区段长度不同或相同。