[发明专利]日本黄姑鱼线粒体全基因组序列的扩增引物及其扩增方法有效

专利信息
申请号: 201510427226.4 申请日: 2015-07-21
公开(公告)号: CN105154526B 公开(公告)日: 2018-06-15
发明(设计)人: 胡则辉;柴学军;王跃斌;朱云海 申请(专利权)人: 浙江省海洋水产研究所
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888;C12N15/11
代理公司: 杭州杭诚专利事务所有限公司 33109 代理人: 尉伟敏;赵越剑
地址: 316021 浙江*** 国省代码: 浙江;33
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摘要: 发明公开了一种日本黄姑鱼线粒体全基因组序列的扩增引物及其扩增方法,通过20对特异性引物对日本黄姑鱼基因组进行PCR扩增获得日本黄姑鱼线粒体全基因组序列,可为日本黄姑鱼的保护遗传学、进化遗传学及优良养殖品种的分子标记辅助选择提供物质基础。 1
搜索关键词: 线粒体全基因组序列 扩增引物 遗传学 扩增 分子标记辅助选择 特异性引物 物质基础 养殖品种 鱼基因组 进化
【主权项】:
1.一种日本黄姑鱼线粒体全基因组序列的扩增方法,其特征在于,以提取的日本黄姑鱼基因组DNA为模板,首先用4对扩增引物进行4个大片段产物扩增,然后通过基因组步移的方法,使用剩余的16对扩增引物进行PCR扩增,PCR产物经1.0%琼脂糖电泳检测后送生物公司测序;

上述的20对引物对,具体序列信息如下所示:

(1)第1对上游引物为:SEQIDNO.1所示的核苷酸序列,下游引物为:SEQIDNO.2所示的核苷酸序列;

(2)第2对上游引物为:SEQIDNO.3所示的核苷酸序列,下游引物为:SEQIDNO.4所示的核苷酸序列;

(3)第3对上游引物为:SEQIDNO.5所示的核苷酸序列,下游引物为:SEQIDNO.6所示的核苷酸序列;

(4)第4对上游引物为:SEQIDNO.7所示的核苷酸序列,下游引物为:SEQIDNO.8所示的核苷酸序列;

(5)第5对上游引物为:SEQIDNO.9所示的核苷酸序列,下游引物为:SEQIDNO.10所示的核苷酸序列;

(6)第6对上游引物为:SEQIDNO.11所示的核苷酸序列,下游引物为:SEQIDNO.12所示的核苷酸序列;

(7)第7对上游引物为:SEQIDNO.13所示的核苷酸序列,下游引物为:SEQIDNO.14所示的核苷酸序列;

(8)第8对上游引物为:SEQIDNO.15所示的核苷酸序列,下游引物为:SEQIDNO.16所示的核苷酸序列;

(9)第9对上游引物为:SEQIDNO.17所示的核苷酸序列,下游引物为:SEQIDNO.18所示的核苷酸序列;

(10)第10对上游引物为:SEQIDNO.19所示的核苷酸序列,下游引物为:SEQIDNO.20所示的核苷酸序列;

(11)第11对上游引物为:SEQIDNO.21所示的核苷酸序列,下游引物为:SEQIDNO.22所示的核苷酸序列;

(12)第12对上游引物为:SEQIDNO.23所示的核苷酸序列,下游引物为:SEQIDNO.24所示的核苷酸序列;

(13)第13对上游引物为:SEQIDNO.25所示的核苷酸序列,下游引物为:SEQIDNO.26所示的核苷酸序列;

(14)第14对上游引物为:SEQIDNO.27所示的核苷酸序列,下游引物为:SEQIDNO.28所示的核苷酸序列;

(15)第15对上游引物为:SEQIDNO.29所示的核苷酸序列,下游引物为:SEQIDNO.30所示的核苷酸序列;

(16)第16对上游引物为:SEQIDNO.31所示的核苷酸序列,下游引物为:SEQIDNO.32所示的核苷酸序列;

(17)第17对上游引物为:SEQIDNO.33所示的核苷酸序列,下游引物为:SEQIDNO.34所示的核苷酸序列;

(18)第18对上游引物为:SEQIDNO.35所示的核苷酸序列,下游引物为:SEQIDNO.36所示的核苷酸序列;

(19)第19对上游引物为:SEQIDNO.37所示的核苷酸序列,下游引物为:SEQIDNO.38所示的核苷酸序列;

(20)第20对上游引物为:SEQIDNO.39所示的核苷酸序列,下游引物为:SEQIDNO.40所示的核苷酸序列;

其中,上述的4对扩增引物为第1对,第6对,第11对和第16对。

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