[发明专利]一种MMR基因突变检测试剂盒有效
申请号: | 201510437485.5 | 申请日: | 2015-07-23 |
公开(公告)号: | CN106367475B | 公开(公告)日: | 2019-08-30 |
发明(设计)人: | 黄凯;李轩;南蓬 | 申请(专利权)人: | 上海生物信息技术研究中心;中国科学院上海生命科学研究院;复旦大学 |
主分类号: | C12Q1/6869 | 分类号: | C12Q1/6869;C12N15/10 |
代理公司: | 上海光华专利事务所(普通合伙) 31219 | 代理人: | 郭婧婧;许亦琳 |
地址: | 200235 上海*** | 国省代码: | 上海;31 |
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摘要: | 本发明属于分子生物学和医学领域,具体涉及人DNA错配修复基因(mismatch repair genes,MMR)的突变检测试剂盒及其用途,更具体地是涉及人MLH1、MSH2、MSH6、PMS1、PMS2基因的突变检测及其与遗传性非息肉性结直肠癌(HNPCC)相关性的检测。本发明的试剂盒可用于检测个体的MMR基因外显子突变的基因型,为判断该个体是否患有HNPCC以及家族成员患病风险是否大于普通人群提供参考数据。 | ||
搜索关键词: | 一种 mmr 基因突变 检测 试剂盒 | ||
【主权项】:
1.一种检测样品中是否存在MMR基因变异的试剂盒,其特征在于,所述试剂盒中,含有11组多重PCR引物对组合,分别为:(1)引物对组合1:由SEQ ID NO.7和SEQ ID NO.8;SEQ ID NO.23和SEQ ID NO.24;SEQ ID NO.27和SEQ ID NO.28;SEQ ID NO.63和SEQ ID NO.64;SEQ ID NO.97和SEQ ID NO.98;SEQ ID NO.111和SEQ ID NO.112;SEQ ID NO.127和SEQ ID NO.128;SEQ ID NO.149和SEQ ID NO.150组成;(2)引物对组合2:由SEQ ID NO.3和SEQ ID NO.4;SEQ ID NO.33和SEQ ID NO.34;SEQ ID NO.39和SEQ ID NO.40;SEQ ID NO.67和SEQ ID NO.68;SEQ ID NO.77和SEQ ID NO.78;SEQ ID NO.81和SEQ ID NO.82;SEQ ID NO.117和SEQ ID NO.118;SEQ ID NO.137和SEQ ID NO.138;SEQ ID NO.153和SEQ ID NO.154;SEQ ID NO.173和SEQ ID NO.174组成;(3)引物对组合3:由SEQ ID NO.17和SEQ ID NO.18;SEQ ID NO.25和SEQ ID NO.26;SEQ ID NO.37和SEQ ID NO.38;SEQ ID NO.59和SEQ ID NO.60;SEQ ID NO.79和SEQ ID NO.80;SEQ ID NO.101和SEQ ID NO.102;SEQ ID NO.113和SEQ ID NO.114;SEQ ID NO.123和SEQ ID NO.124;SEQ ID NO.141和SEQ ID NO.142;SEQ ID NO.163和SEQ ID NO.164组成;(4)引物组合4:由SEQ ID NO.21和SEQ ID NO.22;SEQ ID NO.35和SEQ ID NO.36;SEQ ID NO.61和SEQ ID NO.62;SEQ ID NO.87和SEQ ID NO.88;SEQ ID NO.99和SEQ ID NO.100;SEQ ID NO.119和SEQ ID NO.120;SEQ ID NO.133和SEQ ID NO.134;SEQ ID NO.147和SEQ ID NO.148;SEQ ID NO.155和SEQ ID NO.156;SEQ ID NO.159和SEQ ID NO.160组成;(5)引物组合5:由SEQ ID NO.5和SEQ ID NO.6;SEQ ID NO.19和SEQ ID NO.20;SEQ ID NO.41和SEQ ID NO.42;SEQ ID NO.47和SEQ ID NO.48;SEQ ID NO.55和SEQ ID NO.56;SEQ ID NO.89和SEQ ID NO.90;SEQ ID NO.95和SEQ ID NO.96;SEQ ID NO.115和SEQ ID NO.116组成;(6)引物组合6:由SEQ ID NO.11和SEQ ID NO.12;SEQ ID NO.31和SEQ ID NO.32;SEQ ID NO.53和SEQ ID NO.54;SEQ ID NO.65和SEQ ID NO.66;SEQ ID NO.75和SEQ ID NO.76;SEQ ID NO.91和SEQ ID NO.92;SEQ ID NO.103和SEQ ID NO.104;SEQ ID NO.109和SEQ ID NO.110;SEQ ID NO.125和SEQ ID NO.126;SEQ ID NO.161和SEQ ID NO.162组成;(7)引物组合7:由SEQ ID NO.1和SEQ ID NO.2;SEQ ID NO.15和SEQ ID NO.16;SEQ ID NO.57和SEQ ID NO.58;SEQ ID NO.85和SEQ ID NO.86;SEQ ID NO.93和SEQ ID NO.94;SEQ ID NO.129和SEQ ID NO.130;SEQ ID NO.145和SEQ ID NO.146;SEQ ID NO.9和SEQ ID NO.10组成;(8)引物组合8:由SEQ ID NO.13和SEQ ID NO.14;SEQ ID NO.29和SEQ ID NO.30;SEQ ID NO.49和SEQ ID NO.50;SEQ ID NO.69和SEQ ID NO.70;SEQ ID NO.83和SEQ ID NO.84;SEQ ID NO.121和SEQ ID NO.122;SEQ ID NO.131和SEQ ID NO.132;SEQ ID NO.135和SEQ ID NO.136;SEQ ID NO.43和SEQ ID NO.44组成;(9)引物组合9:由SEQ ID NO.105和SEQ ID NO.106;SEQ ID NO.73和SEQ ID NO.74组成;(10)引物组合10:由SEQ ID NO.107和SEQ ID NO.108;SEQ ID NO.71和SEQ ID NO.72;SEQ ID NO.171和SEQ ID NO.172组成;(11)引物组合11:由SEQ ID NO.139和SEQ ID NO.140;SEQ ID NO.151和SEQ ID NO.152;SEQ ID NO.165和SEQ ID NO.166;SEQ ID NO.167和SEQ ID NO.168;SEQ ID NO.169和SEQ ID NO.170;SEQ ID NO.51和SEQ ID NO.52;SEQ ID NO.143和SEQ ID NO.144;SEQ ID NO.157和SEQ ID NO.158;SEQ ID NO.45和SEQ ID NO.46组成。
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