[发明专利]以GLUT1为靶点的计算机药物筛选方法及其应用在审
申请号: | 201510449955.X | 申请日: | 2015-07-29 |
公开(公告)号: | CN106709271A | 公开(公告)日: | 2017-05-24 |
发明(设计)人: | 张崇骞;王绪文;李保坤 | 申请(专利权)人: | 张崇骞 |
主分类号: | G06F19/16 | 分类号: | G06F19/16 |
代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
地址: | 215123 江苏省苏州市*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | 本发明的以GLUT1为靶点的计算机药物筛选方法及其应用属于高通量虚拟筛选领域,计算机辅助药物设计范畴,特别涉及一种多精度计算机药物筛选方法及其在筛选有生物活性的先导化合物上的应用。具体以分子对接及基于Glide程序的高通量筛选、标准筛选及附加筛选对Specs数据库及Chembridge数据库进行高精度虚拟筛选并验证筛选出的先到化合物的生物活性。 | ||
搜索关键词: | glut1 计算机 药物 筛选 方法 及其 应用 | ||
【主权项】:
一种以GLUT1为靶点的计算机药物筛选方法,其特征在于以分子对接及多精准度虚拟筛选技术为基础进行计算机药物筛选设计,包含以下五个步骤:(1)GLUT1晶体结构进行评估;(2)使用分子对接分子对接区分GLUT1抑制剂和非抑制剂的能力进行评估;(3)根据评估的结果挑选最佳的晶体结构作为分子对接的模板;(4)利用ACD/ADME软件包计算这些分子的分子性质并保存;(5)虚拟筛选;(6)将第一轮筛选结果用REOS规则进行处理;(7)基于细胞生物学实验的先导化合物分子活性测试。
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G06 计算;推算;计数
G06F 电数字数据处理
G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学,即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真,例如:概率模型或动态模型,遗传基因管理网络,蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的,例如:进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的,例如:结构排序,结构或功能关系,蛋白质折叠,结构域拓扑,用结构数据的药靶,涉及二维或三维结构的
G06F19-18 ..用于功能性基因组学或蛋白质组学的,例如:基因型–表型关联,不均衡连接,种群遗传学,结合位置鉴定,变异发生,基因型或染色体组的注释,蛋白质相互作用或蛋白质核酸的相互作用
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G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
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