[发明专利]一种单分子靶向测序方法、装置、系统及应用在审

专利信息
申请号: 201510501300.2 申请日: 2015-08-14
公开(公告)号: CN105112516A 公开(公告)日: 2015-12-02
发明(设计)人: 葛良进;刘松;林群婷;刘丽春;曾立董;黄莎莎;黄亮;李改玲 申请(专利权)人: 深圳市瀚海基因生物科技有限公司
主分类号: C12Q1/68 分类号: C12Q1/68;C12M1/38;C12M1/36;C12M1/34
代理公司: 广州三环专利代理有限公司 44202 代理人: 郝传鑫;熊永强
地址: 518000 广东省深圳市南山区西丽街道*** 国省代码: 广东;44
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摘要: 发明提供了一种单分子靶向测序(SMTS)方法、装置、系统及应用,所述方法包括:(i)将靶向引物连接到基底表面;(ii)将靶向引物与末端修饰有光学检测标记的模板核酸进行杂交形成靶向引物/模板核酸复合物;(iii)对复合物进行成像;(iv)添加带光学检测标记的核苷酸,使之延伸至探针引物链的3’端;(v)对延伸中的靶向引物链进行成像以鉴定步骤(iv)引入的核苷酸种类;(vi)除去延伸产物上带光学检测标记的核苷酸的可断裂的基团:(vii)重复步骤(iii)至(vi)一次或多次。本发明提供的单分子靶向测序方案通过靶向引物捕获模板核酸,实现单分子靶向测序。
搜索关键词: 一种 分子 靶向 方法 装置 系统 应用
【主权项】:
一种单分子靶向测序方法,其特征在于,包括:(i)将靶向引物的5’端连接到基底表面;(ii)将末端修饰有光学检测标记的模板核酸与所述步骤(i)中连接到基底表面上的靶向引物进行杂交,形成杂交的靶向引物/模板核酸复合物;(iii)对所述靶向引物/模板核酸复合物进行成像;(iv)将所述靶向引物/模板核酸复合物、聚合酶以及一种或多种带光学检测标记的核苷酸混合,通过聚合酶反应将一种或多种带光学检测标记的核苷酸添加至靶向引物链的3’端;获得延伸产物;(v)对延伸后的靶向引物/模板核酸复合物进行成像,并结合步骤(iii)中靶向引物/模板核酸复合物的定位结果,进行图像比对和纠偏,以鉴定模板核酸上的待测核苷酸序列;(vi)除去延伸产物上带光学检测标记的核苷酸的可断裂的基团:(vii)重复步骤(iii)至(vi)一次或多次以鉴定所述模板核酸中的1个或多个核苷酸。
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