[发明专利]一种宏基因组16S rRNA的高通量测序数据处理及分析流程控制方法有效

专利信息
申请号: 201510556935.2 申请日: 2015-09-06
公开(公告)号: CN105279391A 公开(公告)日: 2016-01-27
发明(设计)人: 朱文杰;张鑫磊;袁骁 申请(专利权)人: 苏州协云和创生物科技有限公司
主分类号: G06F19/10 分类号: G06F19/10
代理公司: 苏州创元专利商标事务所有限公司 32103 代理人: 范晴
地址: 215123 江苏省苏州*** 国省代码: 江苏;32
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摘要: 发明公开了一种宏基因组16S rRNA的高通量测序数据处理及分析流程控制方法,其首先由系统生成自定义参数配置文件,再根据用户设定参数后的自定义参数文件和高通量数据处理流程模块生成与数据流程对应的批处理可执行文件;由系统执行批处理可执行文件,实现数据流程自动化,最终生成结果报告文件。从而能高效的帮助生物信息分析人员完成一套标准化的高通量数据分析流程,甚至可以让不懂高通量数据分析的科研人员自己完成高通量数据分析。从而可以达到优化科研人员的工作效率,降低科研成本的目的。本发明不仅仅可以用于宏基因组16S rRNA高通量数据分析流程,也可用于18S和ITS等高通量测序分析流程,甚至可以在高通量测序领域通用,其实现方法简单,应用范围较为广泛。
搜索关键词: 一种 宏基 16 rrna 通量 序数 处理 分析 流程 控制 方法
【主权项】:
一种宏基因组16S rRNA的高通量测序数据处理及分析流程控制方法,其特征在于,其包括如下步骤:(1)自定义参数配置文件的生成步骤;导入宏基因组16S rRNA高通量测序原始序列数据,经过筛选和拼接得到理论上有效的16S rRNA可变区全长序列,在此基础上进行生物信息学参数分析;(2)输入步骤:用户根据需要,输入设定的各参数配置文件;(3)分析步骤:根据参数配置文件,宏基因组高通量数据处理流程模块生成对应的自动化分析流程;(4)执行及输出步骤:执行所描述的自动化分析流程,获得并输出宏基因组16S rRNA分析结果报告。
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