[发明专利]藜麦EST-SSR分子标记及其应用有效
申请号: | 201510595296.0 | 申请日: | 2015-09-17 |
公开(公告)号: | CN105087574B | 公开(公告)日: | 2018-06-12 |
发明(设计)人: | 张体付;赵涵;戚维聪 | 申请(专利权)人: | 江苏省农业科学院 |
主分类号: | C12N15/11 | 分类号: | C12N15/11;C12Q1/6895 |
代理公司: | 上海精晟知识产权代理有限公司 31253 | 代理人: | 冯子玲 |
地址: | 210014*** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | 本发明涉及分子标记技术领域,具体涉及藜麦EST‑SSR分子标记及其开发方法与应用。一组藜麦EST‑SSR分子标记包括66个位点所对应的正向和反向引物,其开发方法包括步骤:1)从NCBI数据库获得RNA‑seq及EST序列;2)利用生物信息学软件对序列进行处理、组装、拼接成unigene,并对unigene进行SSR位点搜索获取EST‑SSR;3)设计EST‑SSR引物扩增藜麦基因组DNA对EST‑SSR进行验证,利用验证的EST‑SSR分子标记在藜科种质中进行遗传多样性分析的应用。本发明基于公共数据库开发的EST‑SSR分子标记具有高效性,成功率高、多态性丰富,且通用性较强。 | ||
搜索关键词: | 验证 应用 生物信息学软件 遗传多样性分析 分子标记技术 公共数据库 基因组DNA 反向引物 分子标记 多态性 高效性 个位 开发 扩增 位点 正向 藜科 拼接 成功率 种质 搜索 组装 | ||
【主权项】:
一组藜麦EST‑SSR分子标记,其特征在于:包括有如下66个位点所对应的正向和反向引物:
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