[发明专利]一种用于预测癌症病人预后相关的蛋白质对的方法有效
| 申请号： | 201510598608.3 | 申请日： | 2015-09-18 |
| 公开（公告）号： | CN105243294B | 公开（公告）日： | 2017-06-09 |
| 发明（设计）人： | 张际峰;芮存芳 | 申请（专利权）人： | 淮南师范学院 |
| 主分类号： | G06F19/18 | 分类号： | G06F19/18 |
| 代理公司： | 南京知识律师事务所32207 | 代理人： | 汪旭东 |
| 地址： | 23203*** | 国省代码： | 安徽;34 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种用于预测癌症病人预后相关的蛋白质对的方法，属于癌症预后及治疗领域。本发明的步骤为(1)从GEO数据库中下载与癌症对应的基因芯片数据，同时找出该数据的原始文件中的生存相关的数据；(2)预测与癌症病人预后相关的基因；(3)利用该基因从蛋白质互作对数据库中过滤出与癌症病人预后相关的蛋白质互作对。本发明方法的应用利用预测与癌症预后相关的蛋白质互作对设计治疗该癌症的药物，该药物在蛋白质互作对中产生竞争性作用，从而破坏原有的蛋白质互作对。本发明的方法是一种更为精确的预测癌症的预后相关的蛋白质对的方法，且其更有助于从细胞内干扰蛋白质相互作用的角度设计癌症治疗的药物。 | ||
| 搜索关键词： | 一种 用于 预测 癌症病人 预后 相关 蛋白 质对 方法 | ||
【主权项】：
一种用于预测癌症病人预后相关的蛋白质对的方法，其特征在于：预测癌症病人预后相关的基因，预后指癌症病人可能的生存期，之后，利用该基因从蛋白质互作对数据库中进一步过滤出与癌症病人预后相关的蛋白质互作对，定义预后相关蛋白质对为蛋白质对中的两个基因同时属于此预后相关基因，其具体步骤为：(1)从GEO数据库中下载与癌症对应的基因芯片数据，同时找出该数据的原始文件中的生存相关的数据；(2)预测与癌症病人预后相关的基因，其方法为：定义利用log‑rank test检验方法计算获得的P值为P1，定义利用COX模型分析方法计算获得的P值为P2，当P′≤0.05时，认为该基因与癌症预后有关；(3)利用该基因从蛋白质互作对数据库中过滤出与癌症病人预后相关的蛋白质互作对。
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