[发明专利]联合mRNA和microRNA表达谱芯片的肿瘤特征基因选择方法在审
| 申请号： | 201510627272.9 | 申请日： | 2015-09-28 |
| 公开（公告）号： | CN105243296A | 公开（公告）日： | 2016-01-13 |
| 发明（设计）人： | 李小波 | 申请（专利权）人： | 丽水学院 |
| 主分类号： | G06F19/18 | 分类号： | G06F19/18 |
| 代理公司： | 杭州浙科专利事务所(普通合伙) 33213 | 代理人： | 张健 |
| 地址： | 323000 *** | 国省代码： | 浙江;33 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种联合mRNA和microRNA表达谱芯片的肿瘤特征基因选择方法，按照以下步骤具体实施：步骤1、通过mRNA和microRNA表达谱芯片检测到大量基因的表达值，采用过滤式特征基因选择方法对所有基因的相关性进行排序，去除大量的低相关度基因，留下少量与肿瘤分类密切相关的基因；步骤2、将采用过滤式特征基因选择方法获取的mRNA和microRNA特征基因进行合并，形成基因池U；步骤3、通过遗传算法，对基因池进一步选择基因，消除冗余基因，搜索获得一个最优特征的最优基因集S。本发明的方法，步骤简单，结果准确性高。 | ||
| 搜索关键词： | 联合 mrna microrna 表达 芯片 肿瘤 特征 基因 选择 方法 | ||
【主权项】：
一种联合mRNA和microRNA表达谱芯片的肿瘤特征基因选择方法，其特征在于，按照以下步骤具体实施：步骤1、通过mRNA和microRNA表达谱芯片检测到大量基因的表达值，采用过滤式特征基因选择方法对所有基因的相关性进行排序，去除大量的低相关度基因，留下少量与肿瘤分类密切相关的基因，通过过滤式特征基因选择方法的选择实施，分别去除mRNA和microRNA表达谱芯片中大量的低相关度基因，留下少量与肿瘤分类密切相关的基因，分别在mRNA和microRNA表达谱中选取得分最高的n个基因；步骤2、将采用过滤式特征基因选择方法获取的mRNA和microRNA特征基因进行合并，形成基因池U；步骤3、通过遗传算法，对基因池进一步选择基因，消除冗余基因，搜索获得一个最优特征的最优基因集S，使其具有更少的基因数量和更好的分类性能。
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G06 计算；推算；计数
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G06F19-00 专门适用于特定应用的数字计算或数据处理的设备或方法
G06F19-10 .生物信息学，即计算分子生物学中的遗传或蛋白质相关的数据处理方法或系统
G06F19-12 ..用于系统生物学的建模或仿真，例如：概率模型或动态模型，遗传基因管理网络，蛋白质交互作用网络或新陈代谢作用网络
G06F19-14 ..用于发展或进化的，例如：进化的保存区域决定或进化树结构
G06F19-16 ..用于分子结构的，例如：结构排序，结构或功能关系，蛋白质折叠，结构域拓扑，用结构数据的药靶，涉及二维或三维结构的
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