[发明专利]评价疫苗免疫效果的系统

摘要

本发明公开了一种评价疫苗免疫效果的系统，该系统包括：序列提供装置、参数确定装置和疫苗免疫效果判断装置，其中，所述疫苗免疫效果判断装置被设置为当满足选自下列条件的至少之一时，判定所述疫苗免疫效果好：(1)相对于免疫前，免疫后样本的TCR/BCR的CDR3编码序列克隆种类数目降低；(2)相对于免疫前，免疫后样本的多态性值显著降低；(3)相对于免疫前，免疫后样本的高频扩增克隆的数目增加，并且所有高频扩增克隆的丰度和显著增加；(4)当CDR3编码序列来自BCR时，相对于免疫前，免疫后样本的碱基突变率上升。利用该系统能够快速、准确地评价疫苗的免疫效果。

主权项

1.一种评价疫苗免疫效果的系统，其特征在于，包括：序列提供装置，所述序列提供装置用于提供在利用所述疫苗进行免疫前后样本的T细胞受体TCR/B细胞受体BCR的CDR3编码序列；参数确定装置，所述参数确定装置与所述序列提供装置相连，用于基于所述免疫前后样本的TCR/BCR的CDR3编码序列，分别确定所述免疫前后样本的碱基突变率、CDR3编码序列克隆种类、多态性值、高频扩增克隆中新克隆的数目以及所有高频扩增克隆的丰度和；疫苗免疫效果判断装置，所述疫苗免疫效果判断装置与所述参数确定装置相连，用于基于所述免疫前后样本的碱基突变率、CDR3编码序列克隆种类和多态性值，以及免疫后样本的高频扩增克隆中新克隆的数目以及所有高频扩增克隆的丰度和，确定所述疫苗的免疫效果，其中，所述疫苗免疫效果判断装置被设置为当满足选自下列条件的至少之一时，判定所述疫苗免疫效果好：(1)相对于免疫前，免疫后样本的TCR/BCR的CDR3编码序列克隆种类数目降低；(2)相对于免疫前，免疫后样本的多态性值显著降低；(3)相对于免疫前，免疫后样本的高频扩增克隆中新克隆的数目增加，并且所有高频扩增克隆的丰度和显著增加；(4)当CDR3编码序列来自BCR时，相对于免疫前，免疫后样本的碱基突变率上升；所述参数确定装置进一步包括：CDR3克隆种类确定单元，所述CDR3克隆种类确定单元用于基于所述免疫前后样本的TCR/BCR的CDR3编码序列，分别确定所述免疫前后样本的CDR3编码序列克隆种类；多态性值确定单元，所述多态性值确定单元与所述CDR3克隆种类确定单元相连，用于基于所述免疫前后的样本CDR3编码序列克隆种类，分别确定所述免疫前后样本的多态性值；高频扩增克隆确定单元，所述高频扩增克隆确定单元分别与所述CDR3克隆种类确定单元和所述多态性值确定单元相连，用于基于所述免疫前后样本的CDR3编码序列克隆种类和多态性值，确定所述样本中高频扩增克隆的种类、高频扩增克隆中新克隆的数目，以及所有高频扩增克隆的丰度和；以及碱基突变率确定单元，所述碱基突变率确定单元用于基于所述免疫前后样本的BCR的CDR3编码序列，分别确定所述样本免疫前后的碱基突变率。