[发明专利]测序基因分型技术中测序酶切组合的确定方法有效
| 申请号： | 201510660486.6 | 申请日： | 2015-10-13 |
| 公开（公告）号： | CN105368930B | 公开（公告）日： | 2018-11-20 |
| 发明（设计）人： | 胡晓湘;王宇哲;曹学敏;李宁 | 申请（专利权）人： | 中国农业大学 |
| 主分类号： | C12Q1/6858 | 分类号： | C12Q1/6858 |
| 代理公司： | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人： | 王文君 |
| 地址： | 100193 *** | 国省代码： | 北京;11 |
| 权利要求书： | 查看更多 | 说明书： | 查看更多 |
| 摘要： | 本发明提供了一种测序基因分型技术中测序酶切组合的确定方法，包括以下步骤：(1)对目的基因组进行限制性内切酶酶切位点预测，统计不同酶切方式获得的酶切片段数目；(2)根据步骤(1)中所预测的各种酶切方式的酶切片段设计每种酶切片段两端的接头序列及PCR扩增引物序列；(3)分别针对不同酶切方式利用GBS技术构建测序文库；(4)利用步骤(3)构建的测序文库进行测序；(5)根据测序结果获得SNP标记位点；(6)根据不同酶切组合所获得的SNP标记位点个数、酶切片段大小确定针对目的基因组的特定酶切组合。 | ||
| 搜索关键词： | 基因 技术 中测序酶切 组合 确定 方法 | ||
【主权项】：
1.一种基于测序基因分型技术的重要农业经济动物SNP标记位点的分析方法，其特征在于，包括以下步骤：(1)对目的基因组进行限制性内切酶酶切位点预测，统计不同酶切方式获得的酶切片段数目；(2)根据步骤(1)中所预测的各种酶切方式的酶切片段设计每种酶切片段两端的接头序列及PCR引物序列；(3)分别针对不同酶切方式利用GBS技术构建测序文库；(4)利用步骤(3)构建的测序文库进行测序；(5)根据测序结果获得SNP标记位点；(6)根据不同酶切组合所获得的SNP标记位点个数、酶切片段大小确定针对目的基因组的特定酶切组合EcoR I‑Msp I；其中，在步骤(1)中，对目的基因组的酶切位点预测为双酶切预测；所述重要农业经济动物为牛或羊；步骤(1)中所述的酶切方式包括如表1所示的8种双酶组合方式；表1![]()
步骤(2)中每种酶切片段的接头序列包括通用接头和条形码接头；其中，所述通用接头由通用接头序列1和通用接头序列2退火形成，所述条形码接头由条形码接头序列1和条形码接头序列2退火形成；所述通用接头序列，条形码接头序列及PCR引物序列如下表3所示：表3![]()
![]()
下载完整专利技术内容需要扣除积分，VIP会员可以免费下载。
该专利技术资料仅供研究查看技术是否侵权等信息，商用须获得专利权人授权。该专利全部权利属于中国农业大学，未经中国农业大学许可，擅自商用是侵权行为。如果您想购买此专利、获得商业授权和技术合作，请联系【客服】
本文链接：http://www.vipzhuanli.com/patent/201510660486.6/，转载请声明来源钻瓜专利网。
