[发明专利]DNA条形码结合二代高通量测序快速鉴别A型流感病毒亚型的引物组和方法在审
| 申请号： | 201510665904.0 | 申请日： | 2015-10-15 |
| 公开（公告）号： | CN105255864A | 公开（公告）日： | 2016-01-20 |
| 发明（设计）人： | 孙涛;尹伟力;房保海;岳志芹;梁成珠 | 申请（专利权）人： | 山东出入境检验检疫局检验检疫技术中心 |
| 主分类号： | C12N15/11 | 分类号： | C12N15/11;C12Q1/70;C12Q1/68;C12R1/93 |
| 代理公司： | 济南泉城专利商标事务所 37218 | 代理人： | 刘帅帅 |
| 地址： | 266002 山*** | 国省代码： | 山东;37 |
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| 摘要： | 本发明公开了一种DNA条形码结合二代高通量测序快速鉴别A型流感病毒亚型方法用的引物组和方法，包括下列步骤：（1）基因组提取及反转录；（2）引物设计与PCR扩增；（3）Ion Torrent测序；（4）生物信息学分析；（5）系统进化分析与遗传距离计算。本发明通过对16种不同地域和亚型的A型流感病毒材料的序列进行分析，发现了可区分各亚型的DNA条码；利用DNA条形码技术思路，采用传统RT-PCR检测方法，优选touch-down程序可以快速判定有无流感病毒，并能同时测定A型流感病毒的亚型及致病型，是一种更简单，更快速流感分型诊断程序。 | ||
| 搜索关键词： | dna 条形码 结合 二代 通量 快速 鉴别 流感病毒 引物 方法 | ||
【主权项】：
DNA条形码结合二代高通量测序快速鉴别A型流感病毒亚型方法用的引物组，其特征在于，引物序列如下：（1）HA‑barcoding‑F：GGAATGATHGAYGGNTGGTATGGCAHA‑barcoding‑R：ATATCGTCTCGTATTAGTAGAAACAAGGGTGTTTTGCA（2）NA‑barcoding‑F：GTAAAACGACGGCCAGTGRACHCARGARTCIKMRNA‑barcoding‑R：CAGGAAACAGCTATGACCCIIKCCARTTRTCYCTR。
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