[发明专利]构建高分辨率、大信息量单细胞Hi-C文库的方法有效
申请号: | 201510680615.8 | 申请日: | 2015-10-19 |
公开(公告)号: | CN106591955B | 公开(公告)日: | 2019-10-29 |
发明(设计)人: | 李小林;张介中;赵红梅;裴志华;玄兆伶;李大为;梁峻彬;陈重建 | 申请(专利权)人: | 浙江安诺优达生物科技有限公司;安诺优达基因科技(北京)有限公司;安诺优达(义乌)医学检验有限公司 |
主分类号: | C40B50/06 | 分类号: | C40B50/06;C12Q1/6869 |
代理公司: | 北京彩和律师事务所 11688 | 代理人: | 闫桑田 |
地址: | 322000 浙江省义乌市*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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摘要: | 本发明提供一种构建高分辨率、大信息量单细胞Hi‑C文库的方法。该方法起始样本量少、分辨率高、信息量大、且操作简便。本发明的构建Hi‑C文库的方法包括下述步骤:获得少量的被固定化的染色质;对所述步骤B中获得的被固定化的染色质进行消化,得到被固定化的染色质片段;将所述步骤C中得到的被固定化的染色质片段直接进行重新连接,得到重新连接的被固定化的染色质片段;使所述步骤D中得到的重新连接的被固定化的染色质片段解除固定化,释放DNA片段;对所述步骤E中释放的DNA片段进行扩增,得到扩增产物;以及,以所述扩增产物作为待测序DNA片段,构建测序用DNA文库。 | ||
搜索关键词: | 固定化 染色质片段 构建 重新连接 文库 大信息量 高分辨率 扩增产物 染色质 测序 起始样本 释放 分辨率 扩增 信息量 消化 | ||
【主权项】:
1.一种构建Hi‑C文库的方法,该方法包括下述步骤:步骤B:获得少量的被固定化的染色质,所述少量的被固定化的染色质是10‑6~102ng的染色质,以裸DNA计;步骤C:对所述步骤B中获得的被固定化的染色质进行消化,得到被固定化的染色质片段;步骤D:将所述步骤C中得到的被固定化的染色质片段直接进行重新连接,得到重新连接的被固定化的染色质片段;步骤E:使所述步骤D中得到的重新连接的被固定化的染色质片段解除固定化,释放DNA片段;步骤F:对所述步骤E中释放的DNA片段进行扩增,得到扩增产物;以及步骤H:以所述扩增产物作为待测序DNA片段,构建测序用DNA文库。
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