[发明专利]用于鉴别金华两头乌和杜洛克猪遗传背景的分子标记及其应用有效

专利信息
申请号: 201510700405.0 申请日: 2015-10-26
公开(公告)号: CN105256035B 公开(公告)日: 2018-08-10
发明(设计)人: 潘建治;黄菁;朱志伟;何水平;朱俭文;陈晓宇;于福先;贾若欣 申请(专利权)人: 浙江省农业科学院;义乌市华统养殖有限公司
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888;C12N15/11
代理公司: 浙江杭州金通专利事务所有限公司 33100 代理人: 王佳健
地址: 310021 *** 国省代码: 浙江;33
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摘要: 发明提供能鉴别金华两头乌和杜洛克猪遗传背景的分子标记及其应用。本发明通过分别对两个猪种的10个无亲缘关系个体的基因组进行PCR扩增和测序,筛选到一批单核苷酸多态位点(SNP)在两个猪种基因组序列中呈现完全不同的基因型。本发明涉及的分子标记可有效用于鉴别金华两头乌和杜洛克猪的遗传背景,从而提高猪新品种的选育效率。
搜索关键词: 用于 鉴别 金华 两头 洛克 遗传 背景 分子 标记 及其 应用
【主权项】:
1.能用于鉴别金华两头乌和杜洛克猪遗传背景的分子标记,其特征在于:PCR扩增及测序用引物对为:1)PCR扩增染色体位置1: 134630347的引物对,名称为CHR1‑0.6,其核苷酸序列为:正向引物:5’‑ TTTCTCTCTCCTCCCGTTGTCC‑3’(SEQ ID NO:1)反向引物:5’‑ GGATCTCGTCGTATCTGTCGTTGT‑3’(SEQ ID NO:2)和2)PCR扩增染色体位置1: 252778743、1: 252778772和1: 252778784的引物对,名称为CHR1‑0.8,其核苷酸序列为:正向引物:5’‑ GGCAGGTATGTGAGGGAGTAAG‑3’(SEQ ID NO:3)反向引物:5’‑ CAACTGAAAGACAAGCAAGGGA‑3’(SEQ ID NO:4)和3) PCR扩增染色体位置2: 77836943和2: 77837328的引物对,名称为CHR2‑0.4 ,其核苷酸序列为:正向引物:5’‑ ATGACGCCAAGGACGCTATGAT‑3’(SEQ ID NO:5)反向引物:5’‑ GAGGGCAGTCTTGGACCTTGTG‑3’(SEQ ID NO:6)和4) PCR扩增染色体位置2: 134847397和2: 134847637的引物对,名称为,CHR2‑0.8 ,其核苷酸序列为:正向引物:5’‑ GTCACCCCATCTCCCTCATCA‑3’(SEQ ID NO:7)反向引物:5’‑ GTTGGGAGGCTTTCTATTCACG ‑3’(SEQ ID NO:8)和5) PCR扩增染色体位置4: 7774260、4: 7774424、4: 7774579、4: 7774608、4: 7774691和4:7774694的引物对,名称为,CHR4‑0.1 ,其核苷酸序列为:正向引物:5’‑ GAGGGTGAGGTCCTTCTTCCG ‑3’(SEQ ID NO:9)反向引物:5’‑ GCATTAACCTCGGCTACAACG ‑3’(SEQ ID NO:10)和6) PCR扩增染色体位置4: 103292098的引物对,名称为,CHR4‑0.5,其核苷酸序列为:正向引物:5’‑ GGCAAAAAAACAGGAACGGAA‑3’(SEQ ID NO:11)反向引物:5’‑ CAGTAGTGCCAAGGGTTGAGAAAT‑3’(SEQ ID NO:12)和7) PCR扩增染色体位置4: 103294496、4: 103294659和4:103294753的引物对,名称为,CHR4‑0.6 ,其核苷酸序列为:正向引物:5’‑ GTGGGTTTGTTTCCGCTGAGTC‑3’(SEQ ID NO:13)反向引物:5’‑ CAGTGGCACAGACCCAAAGTCC‑3’(SEQ ID NO:14)和8) PCR扩增染色体位置5: 6043646的引物对,名称为,CHR5‑0.1 ,其核苷酸序列为:正向引物:5’‑ CACATTCCTCGATTCCATCAAAA ‑3’(SEQ ID NO:15)反向引物:5’‑ TCCGAGATTTCCACTTCACCCTG‑3’(SEQ ID NO:16)和9) PCR扩增染色体位置5: 3813619、5: 3813807和5: 3813825的引物对,名称为,CHR5‑0.2 ,其核苷酸序列为:正向引物:5’‑ TCAAATTCGCTGACTCTTCTTG ‑3’(SEQ ID NO:17)反向引物:5’‑ TGTATGTAACTCCCAGGGTCCTAA ‑3’(SEQ ID NO:18)和10) PCR扩增染色体位置6: 11907915和6: 11907918的引物对,名称为,CHR6‑0.1,其核苷酸序列为:正向引物:5’‑ CTAGGCATTGACAGTTTATTGAG‑3’(SEQ ID NO:19)反向引物:5’‑ TATGTATGTGATGATCTTGGAGC ‑3’(SEQ ID NO:20)和11) PCR扩增染色体位置6: 143261070的引物对,名称为,CHR6‑0.9,其核苷酸序列为:正向引物:5’‑ CACAGGATGTTGTCACCGATTC ‑3’(SEQ ID NO:21)反向引物:5’‑ GCCACCTCTGTTTGAGCACTAC ‑3’(SEQ ID NO:22)和12) PCR扩增染色体位置7: 53970246、7: 53970540和7: 53970563的引物对,名称为,CHR7‑0.4,其核苷酸序列为:正向引物:5’‑ CCCTGGTGGGCATTTGGTAAGT ‑3’(SEQ ID NO:23)反向引物:5’‑ TACGGACTGGATGTGAAAAGAGGG ‑3’(SEQ ID NO:24)和13) PCR扩增染色体位置10: 77731799的引物对,名称为,CHR10‑0.9,其核苷酸序列为:正向引物:5’‑ CACGATGTCATGCCCGCCTCC‑3’(SEQ ID NO:25)反向引物:5’‑ AGCAGCGACCCAGCCACTTCA ‑3’(SEQ ID NO:26)和14) PCR扩增染色体位置12: 54040754和12: 54040790的引物对,名称为,CHR12‑0.9 ,其核苷酸序列为:正向引物:5’‑ AAACCAGCTTCCATGCCCTCAC ‑3’(SEQ ID NO:27)反向引物:5’‑ GAAGGCCGTGAACGGGTGAAT ‑3’(SEQ ID NO:28)和15) PCR扩增染色体位置13: 12165720的引物对,名称为,CHR13‑0.1,其核苷酸序列为:正向引物:5’‑ ATACAAGGCCAAGCAAGGTGAG ‑3’(SEQ ID NO:29)反向引物:5’‑ GCTTAGGTTCCAAGGGTTCACA‑3’(SEQ ID NO:30)和16) PCR扩增染色体位置14: 135142388、14: 135142573、14: 135142585、14: 135142623、14: 135142710和14: 135142874的引物对,名称为,CHR14‑0.8 ,其核苷酸序列为:正向引物:5’‑ CAGAACAGGCTTCCCACACATA ‑3’(SEQ ID NO:31)反向引物:5’‑ TGTCTGCCTTTAGTGACCTCTGG ‑3’(SEQ ID NO:32)和17) PCR扩增染色体位置15: 66452502和15: 66452591的引物对,名称为,CHR15‑0.4 ,其核苷酸序列为:正向引物:5’‑ CTGCCTACCCACCCTCATCTTC ‑3’(SEQ ID NO:33)反向引物:5’‑ CTGGACCTCACCCTGGAAAGC ‑3’(SEQ ID NO:34)和18) PCR扩增染色体位置15: 152232628和15: 152232891的引物对,名称为,CHR15‑0.9,其核苷酸序列为:正向引物:5’‑ TCACTTGACAGATTTGGGCAACTTA ‑3’(SEQ ID NO:35)反向引物:5’‑ GAAAGGAAGTATGGCAATCGGAGA ‑3’(SEQ ID NO:36)和19) PCR扩增染色体位置17: 15142058和17: 15142260的引物对,名称为,CHR17‑0.2,其核苷酸序列为:正向引物:5’‑ CCATCCCGCTCTGCTTGCCC ‑3’(SEQ ID NO:37)反向引物:5’‑ ACCCCGACCTGCTGAACCCTG ‑3’(SEQ ID NO:38)和20) PCR扩增染色体位置17: 57845111、17: 57845344和17: 57845409的引物对,名称为,CHR17‑0.8,其核苷酸序列为:正向引物:5’‑ CCTGGATGCTGGGAAGAAATAG ‑3’(SEQ ID NO:39)反向引物:5’‑ GCTCTGGGTGCGGAACTTGTAG ‑3’(SEQ ID NO:40)和21) PCR扩增染色体位置X: 64846147、X: 64846273、X: 64846483、X: 64846543和X: 64846654的引物对,名称为,CHRX‑0.4,其核苷酸序列为:正向引物:5’‑ GTGAATGAGGCAGGATGAACTGG ‑3’(SEQ ID NO:41)反向引物:5’‑ CTCAGCAGCTTGTTGATCTCGTTC ‑3’(SEQ ID NO:42)。
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