[发明专利]一种用于检测肿瘤突变的双标签接头序列及检测方法有效

专利信息
申请号: 201510754103.1 申请日: 2015-11-09
公开(公告)号: CN106086162B 公开(公告)日: 2020-02-21
发明(设计)人: 葛会娟;林清华;金保雷;李旭超;阮力 申请(专利权)人: 厦门艾德生物医药科技股份有限公司
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12Q1/6806;C12Q1/6869;C12N15/11;C12N15/10;C40B50/06
代理公司: 厦门市精诚新创知识产权代理有限公司 35218 代理人: 方惠春
地址: 361000 福*** 国省代码: 福建;35
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摘要: 发明公开了一种用于检测肿瘤突变的双标签接头序列,其特征在于,所述接头序列由接头引物P5和接头引物P7合成,其中接头引物P5为SEQ ID NO:1所示序列,接头引物P7为SEQ ID NO:2所示序列。本发明还提供了建库方法和测序方法。利用本发明的双标签接头,可以准确检测1×10‑5肿瘤突变率,有效提高肿瘤突变检测的灵敏度,结合高通量测序的通量,一次测序可以检测多个基因的多个突变位点。
搜索关键词: 一种 用于 检测 肿瘤 突变 标签 接头 序列 方法
【主权项】:
一种用于检测肿瘤突变的双标签接头序列,其特征在于,所述接头序列由接头引物P5和接头引物P7合成,其中接头引物P5为SEQ ID NO:1通过I5index序列连接SEQ ID NO:2所得序列所示,接头引物P7为FFFFFEEEEEDDDDDNNNNNNNNNNNN依次连接在SEQ ID NO:3的5’端SEQ ID NO:3再通过I7index序列连接SEQ ID NO:4所得序列所示;SEQ ID NO:1:AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACAC;SEQ ID NO:2:ACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT;SEQ ID NO:3:AGATCGGAAGAGCACACGTCTGAACTCCAGTCAC;SEQ ID NO:4:ATCTCGTATGCCGTCTTCTGCTTG;所述FFFFF为酶切位点保护碱基,EEEEE为酶切位点,DDDDD为定位标签序列,NNNNNNNNNNNN为随机分子标签序列;FFFFF、DDDDD、EEEEE包括但不限于5个相同碱基,I7index序列为6‑8个碱基;NNNNNNNNNNNN为4或6或8或12个随机碱基,且没有四个连续相同的碱基;优选的,NNNNNNNNNNNN表示为BDHVBDHVBDHV,其中B表示该位置是除A外的碱基,D位置表示该位置是除C外的碱基,H表示该位置是除G外的碱基,V表示该位置是除T外的碱基。
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